RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 RHOBTB3O94955 611 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNK5O95279 499 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 BCKDHBP21953 392 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 DPP6P42658 865 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 GCLMP48507 274 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAM9Q13443 819 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.33■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 RLN3Q8WXF3 142 aa20.33■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 NCOR2Q9Y618 2525 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 TBX18O95935 607 aa20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 P2RY2P41231 377 aa20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 ENPEPQ07075 957 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 MESP2Q0VG99 397 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 NFIL3Q16649 462 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 CYLDQ9NQC7 956 aa20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 RALAP11233 206 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 RARGP13631 454 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 14.3
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SH3BP2-220ENST00000511663 LMAN2Q12907 356 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 ST3GAL2Q16842 350 aa20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM49CP0CI26 452 aa20.3■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 GTF2H1P32780 548 aa20.3■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 KRT39Q6A163 491 aa20.3■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.3■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 MYH10P35580 1976 aa20.29■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 PRR29P0C7W0 189 aa20.29■□□□□ 0.84
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SH3BP2-220ENST00000511663 PGFP49763 221 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC8A3P57103 927 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 IRX4P78413 519 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP3CAQ08209 521 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 SYT12Q8IV01 421 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 TWNKQ96RR1 684 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 DUSP16Q9BY84 665 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.29■□□□□ 0.84
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