RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487284.2

CUX1-209, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene CUX1, Length 1,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-209ENST00000487284 SLCO2A1Q92959 643 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 STK39Q9UEW8 545 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 LZTS1Q9Y250 596 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 PLXNA3P51805 1871 aa14.84□□□□□ -0.03
CUX1-209ENST00000487284 ESYT3A0FGR9 886 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 MAP2K7O14733 419 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 GRM6O15303 877 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 GRAP2O75791 330 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 SASH3O75995 380 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 BEST1O76090 585 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 LCP1P13796 627 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 SDC4P31431 198 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 OR1D2P34982 312 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CDKN2BP42772 138 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 ERVFC1P60507 584 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 ROR1Q01973 937 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 ADCY1Q08828 1119 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 ADIGQ0VDE8 80 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CUL1Q13616 776 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CCDC14Q49A88 953 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 EMBQ6PCB8 327 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 TMC7Q7Z402 723 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 JAMLQ86YT9 394 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 POF1BQ8WVV4 589 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 RAPGEF5Q92565 580 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 RAB17Q9H0T7 212 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 USP18Q9UMW8 372 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 MYO7AQ13402 2215 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.83□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 WDR27A2RRH5 827 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 LRRD1A4D1F6 860 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 LILRB3O75022 631 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 AP1G2O75843 785 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CA8P35219 290 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CACNA2D1P54289 1103 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 UBE3AQ05086 875 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 GPR17Q13304 367 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 LLGL1Q15334 1064 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 HDXQ7Z353 690 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 PEBP4Q96S96 227 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 SMOQ99835 787 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 TCF25Q9BQ70 676 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 DCLK3Q9C098 648 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 ZWILCHQ9H900 591 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.82□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 MTMR11A4FU01 709 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 H3BNC9 293 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 HSF2BPO75031 334 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 DESP17661 470 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 BDNFP23560 247 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 MAP3K7CLP57077 242 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 GPM6BQ13491 265 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CAMK1Q14012 370 aa14.81□□□□□ -0.04
CUX1-209ENST00000487284 CASP8Q14790 479 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms