RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486549.5

USP4-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 5

Gene USP4, Length 749 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-212ENST00000486549 FAM71AQ8IYT1 594 aa15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 NEK11Q8NG66 645 aa15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 NELL2Q99435 816 aa15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 MIS12Q9H081 205 aa15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 HPS4Q9NQG7 708 aa15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 SIK3Q9Y2K2 1263 aa15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.5■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 LRRC10BA6NIK2 292 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 F8VZ95 297 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 H0Y858 1186 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 NCAM2O15394 837 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 GABBR2O75899 941 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 GPD2P43304 727 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 MAGEA9P43362 315 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 EFEMP1Q12805 493 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 RUNX3Q13761 415 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 BTBD8Q5XKL5 378 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 MIB1Q86YT6 1006 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 PJA1Q8NG27 643 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 CLEC4CQ8WTT0 213 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 HSFY1Q96LI6 401 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 SPAG5Q96R06 1193 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 STK33Q9BYT3 514 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 CNGB3Q9NQW8 809 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 CLIC5Q9NZA1 410 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 WDFY4Q6ZS81 3184 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 FAM170AA1A519 330 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 SHISA7A6NL88 538 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 FAM170BA6NMN3 283 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 YJEFN3A6XGL0 299 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 E7ENQ6 273 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 MAN2B1O00754 1011 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 TEX33O43247 280 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 GFPT2O94808 682 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 SERPINC1P01008 464 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 DCNP07585 359 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 KRT9P35527 623 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 DAOAP59103 153 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 BPIFB4P59827 614 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 EML3Q32P44 896 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 TAF3Q5VWG9 929 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 CPA6Q8N4T0 437 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 FAM3CQ92520 227 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 EDEM1Q92611 657 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 ATP2A3Q93084 1043 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 WBP2Q969T9 261 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 F5P12259 2224 aa15.48■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 PROB1E7EW31 1015 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 NFATC1O95644 943 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 CAVIN2O95810 425 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 HMBSP08397 361 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 CYP11B1P15538 503 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 CTHP32929 405 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 PDCLQ13371 301 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 MEA1Q16626 185 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 C1orf228Q6PIY5 440 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 GOLGA1Q92805 767 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 ECT2Q9H8V3 914 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 PCDHGC3Q9UN70 934 aa15.47■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 E2F8A0AVK6 867 aa15.46■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 E5RJQ4 531 aa15.46■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 FBXO21O94952 628 aa15.46■□□□□ 0.07
USP4-212ENST00000486549 GLULP15104 373 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms