RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MIPP30301 263 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 HOXD13P35453 343 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 IFNAR2P48551 515 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RAD23BP54727 409 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LZTR1Q8N653 840 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PHF24Q9UPV7 400 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 COL4A5P29400 1685 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 F5H423 210 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 KRT38O76015 456 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MMP8P22894 467 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PMS2P54278 862 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 OXCT1P55809 520 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PRAMEP78395 509 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ADCY1Q08828 1119 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MOGSQ13724 837 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CASP8Q14790 479 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC38Q5VT99 294 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MON1AQ86VX9 555 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 AGAP3Q96P47 875 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 IGFLR1Q9H665 355 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CLDN5O00501 218 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GPR32O75388 356 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ERBB2P04626 1255 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 JAM2P57087 298 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TMED2Q15363 201 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SDE2Q6IQ49 451 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NCANO14594 1321 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 CES2O00748 559 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF623O75123 536 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ANXA9O76027 345 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 VNN1O95497 513 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 RHOCP08134 193 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 CYP2F1P24903 491 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 KCNJ1P48048 391 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 CLCN6P51797 869 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 CCNG2Q16589 344 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ADAM32Q8TC27 787 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 MGARPQ8TDB4 240 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF516Q92618 1163 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ERP44Q9BS26 406 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ZMYND15Q9H091 742 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 TGM2P21980 687 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 IGFBP4P22692 258 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 DUSP4Q13115 394 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 DDR2Q16832 855 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 BHMTQ93088 406 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 CYLDQ9NQC7 956 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 FDFT1P37268 417 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 MATKP42679 507 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 SLCO1A2P46721 670 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-211ENST00000486161 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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