RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, human

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NISCH-208	ENST00000481211	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	DEFB123	Q8N688	67 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	RNF139	Q8WU17	664 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	CNPY3	Q9BT09	278 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	IL21	Q9HBE4	155 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	GMIP	Q9P107	970 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	F9	P00740	461 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	RHO	P08100	348 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	NCAM1	P13591	858 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	FOSL2	P15408	326 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	GABRR2	P28476	465 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	GBP1	P32455	592 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	SLC1A1	P43005	524 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	TLR5	O60602	858 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	PROSC	O94903	275 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	RARG	P13631	454 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	WEE1	P30291	646 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	FLT3	P36888	993 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	MTHFR	P42898	656 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	DCAF6	Q58WW2	860 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	NPY6R	Q99463	290 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	NMUR1	Q9HB89	426 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	COG5	Q9UP83	839 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	MYO7A	Q13402	2215 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	LINC01565	O15544	149 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	KIF5C	O60282	957 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	TBX10	O75333	385 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	TADA3	O75528	432 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	GRAP2	O75791	330 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NISCH-208	ENST00000481211	RNF8	O76064	485 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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