RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	YWHAQ	P27348	245 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	CHRNA3	P32297	505 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	HTR7	P34969	479 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	FNTA	P49354	379 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	DNA2	P51530	1060 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	HDAC4	P56524	1084 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SCAP	Q12770	1279 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	TAF5	Q15542	800 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	MS4A14	Q96JA4	679 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	MYRFL	Q96LU7	910 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ASB3	Q9Y575	518 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	FAM170A	A1A519	330 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	VNN2	O95498	520 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	IGLV3-25	P01717	112 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	FYN	P06241	537 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ADH1A	P07327	375 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	RARA	P10276	462 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SLC2A3	P11169	496 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	RALA	P11233	206 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	NCAM1	P13591	858 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SYN1	P17600	705 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	KDELR1	P24390	212 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	IL1R2	P27930	398 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ELF1	P32519	619 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	CDKN2B	P42772	138 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SULT1E1	P49888	294 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ARSE	P51690	589 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	LMNB2	Q03252	620 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	DUSP4	Q13115	394 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	TFDP2	Q14188	446 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	KCTD6	Q8NC69	237 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SLCO2A1	Q92959	643 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	B3GALT6	Q96L58	329 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	LRRC19	Q9H756	370 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	LRRD1	A4D1F6	860 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218		M0QYT0	321 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	PHF2	O75151	1096 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	CTNNB1	P35222	781 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ALDH1A3	P47895	512 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	HCAR3	P49019	387 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	CXCR3	P49682	368 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	TUB	P50607	506 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ARPP19	P56211	112 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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