RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 RARGP13631 454 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 AOC1P19801 751 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CTHP32929 405 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SCNN1AP37088 669 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 USP8P40818 1118 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLCN5P51795 746 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NUBP1P53384 320 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NOMO3P69849 1222 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 FANCCQ00597 558 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CDR2Q01850 454 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NNTQ13423 1086 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NR1I3Q14994 352 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 EML3Q32P44 896 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 IER5LQ5T953 404 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q6ZNB5 142 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 YAF2Q8IY57 180 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PJA1Q8NG27 643 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 IQCDQ96DY2 449 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SHDQ96IW2 340 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPAG5Q96R06 1193 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CPXM1Q96SM3 734 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NAGPAQ9UK23 515 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.7□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TBX18O95935 607 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SERPINC1P01008 464 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGLV3-25P01717 112 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 LTFP02788 710 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CYP17A1P05093 508 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 GLI1P08151 1106 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 STAT1P42224 750 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 MAGEA9P43362 315 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 GABRB2P47870 512 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 RGS7P49802 495 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 FMO1Q01740 532 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 RING1Q06587 406 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TNK2Q07912 1038 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 GAB4Q2WGN9 574 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 HTR3DQ70Z44 454 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC26A9Q7LBE3 791 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CPA6Q8N4T0 437 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLDN23Q96B33 292 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NOX5Q96PH1 765 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 IER2Q9BTL4 223 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 STOML2Q9UJZ1 356 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CA14Q9ULX7 337 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 CEP83Q9Y592 693 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 F5P12259 2224 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 GFRA2O00451 464 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 MAN2B1O00754 1011 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3-206ENST00000469757 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms