RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 RAB6CQ9H0N0 254 aa18.51■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 PNPOQ9NVS9 261 aa18.51■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa18.51■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa18.51■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 H0YIN7 160 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 SIN3BO75182 1162 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 SNNO75324 88 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 LRCH4O75427 683 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 BPGMP07738 259 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 CDK4P11802 303 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 AOC1P19801 751 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 KDELR1P24390 212 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 COPAP53621 1224 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 LRRC38Q5VT99 294 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 MAVSQ7Z434 540 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 PHTF2Q8N3S3 785 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 C1orf21Q9H246 121 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 RAB6BQ9NRW1 208 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 FRMD7Q6ZUT3 714 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 UNC5BQ8IZJ1 945 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 TTLL6Q8N841 843 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 KCTD6Q8NC69 237 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 CSRNP1Q96S65 589 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.5■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ATP9BO43861 1147 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 KRT37O76014 449 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 CST3P01034 146 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 FDFT1P37268 417 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 RGS2P41220 211 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 LIG4P49917 911 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ACAP1Q15027 740 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ADGRF2Q8IZF7 708 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 TFAP2BQ92481 460 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ADCY3O60266 1144 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ALDH1A3P47895 512 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 BBS12Q6ZW61 710 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 MAN1C1Q9NR34 630 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 PTTG2Q9NZH5 202 aa18.49■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ITGAXP20702 1163 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ORC1Q13415 861 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 DBN1Q16643 649 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 DCUN1D1Q96GG9 259 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 STRCQ7RTU9 1775 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 F5H423 210 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 DNAJA2O60884 412 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 SETSIPP0DME0 302 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 SNAPC2Q13487 334 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 PGM2L1Q6PCE3 622 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 C4orf19Q8IY42 314 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 MPP5Q8N3R9 675 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 CCPG1Q9ULG6 757 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 61.7
PREB-208ENST00000468045 TRPA1O75762 1119 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 PTPN7P35236 360 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 RPL5P46777 297 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 TTC13Q8NBP0 860 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 TTLL13PA6NNM8 815 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 H3BSA7 217 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 EXTL3O43909 919 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ARRB2P32121 409 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 KCNJ11Q14654 390 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 GALNT4Q8N4A0 578 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 MASTLQ96GX5 879 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 TAAR1Q96RJ0 339 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 EP400Q96L91 3159 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 MCF2LO15068 1137 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 ABCD1P33897 745 aa18.47■□□□□ 0.55
PREB-208ENST00000468045 MAGEA8P43361 318 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms