RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	PBX3	P40426	434 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ARHGAP8	P85298	464 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	GHRHR	Q02643	423 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	FAP	Q12884	760 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KCNC3	Q14003	757 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	GPR19	Q15760	415 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	PASD1	Q8IV76	773 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NME8	Q8N427	588 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	GPATCH11	Q8N954	259 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	EVI5L	Q96CN4	794 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SCYL1	Q96KG9	808 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	C8orf48	Q96LL4	319 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	FAM227B	Q96M60	508 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MTA3	Q9BTC8	594 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	BOC	Q9BWV1	1114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936		X6R8D5	127 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936		A0A0D9SFI3	127 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SLC12A8	A0AV02	714 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MGEA5	O60502	916 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	HIP1R	O75146	1068 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ULK1	O75385	1050 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	FBXO21	O94952	628 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	EPCAM	P16422	314 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	GIT2	Q14161	759 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	PLCB4	Q15147	1175 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	PPP2R5A	Q15172	486 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF174	Q15697	407 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	VPS52	Q8N1B4	723 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	STAM	Q92783	540 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	LOXL4	Q96JB6	756 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SCLT1	Q96NL6	688 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	PIGS	Q96S52	555 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SDF4	Q9BRK5	362 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	RTKN	Q9BST9	563 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KRT23	Q9C075	422 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	CWH43	Q9H720	699 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	RGS18	Q9NS28	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	WNT16	Q9UBV4	365 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	DSE	Q9UL01	958 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	RAB23	Q9ULC3	237 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	E2F8	A0AVK6	867 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ERICH2	A1L162	156 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	LAMTOR5	O43504	91 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	AKAP10	O43572	662 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	PRKD3	O94806	890 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	C8B	P07358	591 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KCNA2	P16389	499 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KLRC1	P26715	233 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CEP170-209	ENST00000464936	KLRC2	P26717	231 aa		5.04	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms