RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CCT6B	Q92526	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454		A0A087WZ62	844 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CREB3	O43889	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	JTB	O76095	146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ATIC	P31939	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	GATM	P50440	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TIRAP	P58753	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RAB30	Q15771	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ZACN	Q401N2	412 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ERBB2	P04626	1255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	EGR1	P18146	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	CTGF	P29279	349 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	GK	P32189	559 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	GRK6	P43250	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	PTH2R	P49190	550 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	NHLH1	Q02575	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	NPC1	O15118	1278 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	PMPCB	O75439	489 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	C1QL1	O75973	258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	VNN1	O95497	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	HGF	P14210	728 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	RBL1	P28749	1068 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	CD38	P28907	300 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	E2F1	Q01094	437 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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