RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	NEU1	Q99519	415 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RBBP4-208	ENST00000463378	SDF4	Q9BRK5	362 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RBBP4-208	ENST00000463378	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RBBP4-208	ENST00000463378	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RBBP4-208	ENST00000463378	SUFU	Q9UMX1	484 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		6.65	□□□□□ -1.34
RBBP4-208	ENST00000463378	CAPN14	A8MX76	684 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	LEFTY2	O00292	366 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP27B1	O15528	508 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	RAD17	O75943	681 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	WDR47	O94967	919 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	C1QTNF9	P0C862	333 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	OCA2	Q04671	838 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	MESP2	Q0VG99	397 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	FOXL1	Q12952	345 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	METRNL	Q641Q3	311 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ANO7	Q6IWH7	933 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM136A	Q96C01	138 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	GPR20	Q99678	358 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ADM5	C9JUS6	153 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	PSMD9	O00233	223 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	KLK10	O43240	276 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ANP32C	O43423	234 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	GUCY1B2	O75343	617 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TIPRL	O75663	272 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	RECQL4	O94761	1208 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	DRD1	P21728	446 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	PAFAH1B1	P43034	410 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	GALNT2	Q10471	571 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ACOX1	Q15067	660 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	CCNG2	Q16589	344 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	BAK1	Q16611	211 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ST3GAL2	Q16842	350 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	STAM	Q92783	540 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	FAR2	Q96K12	515 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	GNRHR2	Q96P88	292 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	MNT	Q99583	582 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	GPR87	Q9BY21	358 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF536	O15090	1300 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	AGPS	O00116	658 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	NUAK1	O60285	661 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	RPS6KA4	O75676	772 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TSPAN15	O95858	294 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM225B	P0DP42	221 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	HTR7	P34969	479 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	POLD2	P49005	469 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	MAN2A2	P49641	1150 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	CCR9	P51686	369 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	DGKQ	P52824	942 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RBBP4-208	ENST00000463378	TIRAP	P58753	221 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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