RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458646.1

RARB-204, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARB, Length 2,590 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-204ENST00000458646 BTKQ06187 659 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 GRM1Q13255 1194 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 TBCCQ15814 346 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 LIN52Q52LA3 116 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 FAXCQ5TGI0 409 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 MAVSQ7Z434 540 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 PDSS2Q86YH6 399 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 REPS2Q8NFH8 660 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 DEPTORQ8TB45 409 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 HSPH1Q92598 858 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 AKT1S1Q96B36 256 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 ATG4CQ96DT6 458 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 GBP5Q96PP8 586 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 HAPLN3Q96S86 360 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 TTC1Q99614 292 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 CALN1Q9BXU9 219 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 FAM159BA6NKW6 160 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 VWA5AO00534 786 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 CIB2O75838 187 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 KRT37O76014 449 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 OATP04181 439 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 HOXC6P09630 235 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SPATA31D3P0C874 917 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 RAP1GAPP47736 663 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SP2Q02086 613 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 CNTN2Q02246 1040 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 WASHC5Q12768 1159 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 CUL3Q13618 768 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 CCNIQ14094 377 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SFT2D3Q587I9 215 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 ATG16L1Q676U5 607 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 FAM83AQ86UY5 434 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 KCTD6Q8NC69 237 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 FAF2Q96CS3 445 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 EPAS1Q99814 870 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 LHX5Q9H2C1 402 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 OCEL1Q9H607 264 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 S100A14Q9HCY8 104 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 EMCNQ9ULC0 261 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 USP18Q9UMW8 372 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SOX13Q9UN79 622 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.85□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 MAFGO15525 162 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 MSCO60682 206 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 RAD17O75943 681 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 APOEP02649 317 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SLC25A3Q00325 362 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 ORC1Q13415 861 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 MTMR2Q13614 643 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 GRM2Q14416 872 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 ZNF699Q32M78 642 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 MBLAC2Q68D91 279 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 PLD5Q8N7P1 536 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 APBB2Q92870 758 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 TWNKQ96RR1 684 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.84□□□□□ -1.31
RARB-204ENST00000458646 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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