RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa20.61■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 A0A087X0B3 334 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 GCNT3O95395 438 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 TNNC2P02585 160 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 YWHAQP27348 245 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 SYKP43405 635 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 ALCAMQ13740 583 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 E2F4Q16254 413 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 GLRX5Q86SX6 157 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 SNX25Q9H3E2 840 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 HCN2Q9UL51 889 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.6■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 COCHO43405 550 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 NDUFS2O75306 463 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 SURF1Q15526 300 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 ANO4Q32M45 955 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 HECTD3Q5T447 861 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 TMEM25Q86YD3 366 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 MIB1Q86YT6 1006 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 NUP93Q8N1F7 819 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 GPD1LQ8N335 351 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 CD248Q9HCU0 757 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 HPSEQ9Y251 543 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 KNL1Q8NG31 2342 aa20.59■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 TACC1O75410 805 aa20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 SLFN14P0C7P3 912 aa20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 NDUFV2P19404 249 aa20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 WASP42768 502 aa20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 CHPFQ8IZ52 775 aa20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 GBP4Q96PP9 640 aa20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
LTB-210ENST00000429299 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.58■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 ZNF233A6NK53 670 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CBFA2T3O75081 653 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CASP5P51878 434 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 NDUFA8P51970 172 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CACNA2D1P54289 1103 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 FBXO32Q969P5 355 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 GABRG3Q99928 467 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 DKK4Q9UBT3 224 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.57■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 PTPRJQ12913 1337 aa20.56■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 TUBP50607 506 aa20.56■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20.56■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.56■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 MDM1Q8TC05 714 aa20.56■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 ACOX2Q99424 681 aa20.56■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.56■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.56■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa20.56■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 RAXQ9Y2V3 346 aa20.56■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 BPTFQ12830 3046 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 TRIM24O15164 1050 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 MYL1P05976 194 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 IDEP14735 1019 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 GRIK2Q13002 908 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 WDR49Q8IV35 697 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.55■□□□□ 0.88
LTB-210ENST00000429299 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms