RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 NACA2Q9H009 215 aa29.44■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa29.44■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGEF4Q9NR80 690 aa29.44■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 SPHK2Q9NRA0 654 aa29.44■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 USP3Q9Y6I4 520 aa29.44■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 GDF9O60383 454 aa29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 STX10O60499 249 aa29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 EPN2O95208 641 aa29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 SMC2O95347 1197 aa29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 CD44P16070 742 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 GAD2Q05329 585 aa29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 RASSF3Q86WH2 238 aa29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ALLCQ8N6M5 410 aa29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 NAT16Q8N8M0 369 aa29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TRIM24O15164 1050 aa29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 APODP05090 189 aa29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 RARGP13631 454 aa29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 GRIA2P42262 883 aa29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 CRY1Q16526 586 aa29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC186Q7Z3E2 898 aa29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TSTD1Q8NFU3 115 aa29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC35C1Q96A29 364 aa29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM176AQ96HP8 235 aa29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TSG101Q99816 390 aa29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 HCN2Q9UL51 889 aa29.42■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 SGK1O00141 431 aa29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TULP3O75386 442 aa29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 SDHBP21912 280 aa29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TIE1P35590 1138 aa29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TCERG1LQ5VWI1 586 aa29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ISM2Q6H9L7 571 aa29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 KLHDC10Q6PID8 442 aa29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 P2RY11Q96G91 374 aa29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 INVSQ9Y283 1065 aa29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCA7Q8IZY2 2146 aa29.41■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 DCDC2BA2VCK2 349 aa29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ADAM23O75077 832 aa29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 BMP6P22004 513 aa29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TNFRSF4P43489 277 aa29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 DGKEP52429 567 aa29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 LRRC63Q05C16 580 aa29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 PLA2G2CQ5R387 149 aa29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGAP17Q68EM7 881 aa29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 MDGA1Q8NFP4 955 aa29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 RTKNQ9BST9 563 aa29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TPSD1Q9BZJ3 242 aa29.4■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ANO4Q32M45 955 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ANO7Q6IWH7 933 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 Q6ZNB5 142 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TTC30AQ86WT1 665 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF276Q8N554 614 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TTC39CQ8N584 583 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 UBR7Q8N806 425 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 NETO1Q8TDF5 533 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 SMOC1Q9H4F8 434 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 RXFP3Q9NSD7 469 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 DNMT3LQ9UJW3 386 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 NAGPAQ9UK23 515 aa29.39■■■□□ 2.3
TRIOBP-209ENST00000428075 LAMA1P25391 3075 aa29.38■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC30A4O14863 429 aa29.38■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF806P0C7X5 589 aa29.38■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 RAB41Q5JT25 222 aa29.38■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 C10orf120Q5SQS8 335 aa29.38■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 PIGZQ86VD9 579 aa29.38■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 UBXN6Q9BZV1 441 aa29.38■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 TULP2O00295 520 aa29.37■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 CUL2Q13617 745 aa29.37■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKRD52Q8NB46 1076 aa29.37■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 CLIC5Q9NZA1 410 aa29.37■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 DEC1Q9P2X7 70 aa29.37■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 STC2O76061 302 aa29.36■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 KLKB1P03952 638 aa29.36■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 BCKDHBP21953 392 aa29.36■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 PLA2G4AP47712 749 aa29.36■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 BTBD8Q5XKL5 378 aa29.36■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 MIB1Q86YT6 1006 aa29.36■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 TERB1Q8NA31 727 aa29.36■■■□□ 2.29
TRIOBP-209ENST00000428075 OLIG1Q8TAK6 271 aa29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms