RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419302.1

PDCL2P1-201, Transcript of phosducin-like 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PDCL2P1, Length 352 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2P1-201ENST00000419302 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PDCL2P1-201ENST00000419302 HDAC9Q9UKV0 1011 aa3.59□□□□□ -1.83
PDCL2P1-201ENST00000419302 ICKQ9UPZ9 632 aa3.59□□□□□ -1.83
PDCL2P1-201ENST00000419302 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 TTC3P53804 2025 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 H3BML4 177 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 H7C4K7 107 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 USP12O75317 370 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 HSPA6P17066 643 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 HYAL1Q12794 435 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ST3GAL2Q16842 350 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 PELI3Q8N2H9 469 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 C11orf44Q8N8P7 122 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 HOOK2Q96ED9 719 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 WDYHV1Q96HA8 205 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 LRGUKQ96M69 825 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 STK31Q9BXU1 1019 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 DPH1Q9BZG8 443 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 NUAK2Q9H093 628 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 NMRK2Q9NPI5 230 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 DECR2Q9NUI1 292 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 CCP110O43303 1012 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 PLAUP00749 431 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ADRA1DP25100 572 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 MCM5P33992 734 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 B4GALNT1Q00973 533 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 Q6ZTC4 211 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM57BQ71RH2 274 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 P3H2Q8IVL5 708 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 CHPFQ8IZ52 775 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRT78Q8N1N4 520 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 OR56A3Q8NH54 315 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 SUCLG2Q96I99 432 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 SMURF2Q9HAU4 748 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 GABBR1Q9UBS5 961 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 C4orf47A7E2U8 309 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 A8MVJ9 347 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 SNX2O60749 519 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 KLRC1P26715 233 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 KCNJ4P48050 445 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 JAK3P52333 1124 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC12A2P55011 1212 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 GPC5P78333 572 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZXDBP98169 803 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 DEUP1Q05D60 604 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 PPATQ06203 517 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ARHGEF7Q14155 803 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM199Q8N511 208 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ASB5Q8WWX0 329 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 PIGKQ92643 395 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCDH12Q9NPG4 1184 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 FZD4Q9ULV1 537 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 COG5Q9UP83 839 aa3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 F8W810 466 aa3.55□□□□□ -1.84
PDCL2P1-201ENST00000419302 RAB27BO00194 218 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms