RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411670.5

CCDC18-AS1-201, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 675 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CISD3P0C7P0 127 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NCAM1P13591 858 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TYRP14679 529 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CD6P30203 668 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HOXD13P35453 343 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SLC5A3P53794 718 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CLDN6P56747 220 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MYO1EQ12965 1108 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FUT11Q495W5 492 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HECTD3Q5T447 861 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NUP93Q8N1F7 819 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GPD1LQ8N335 351 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HPS3Q969F9 1004 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 OTUB2Q96DC9 234 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MMS19Q96T76 1030 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GAREM1Q9H706 876 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 OSER1Q9NX31 292 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 IL37Q9NZH6 218 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.45□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 A0A087X0B3 334 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 A0A1B0GTW7 788 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 A0A1B0GVT2 93 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FAM92AA1XBS5 289 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MEI4A8MW99 385 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NDUFS2O75306 463 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TACC1O75410 805 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BEST1O76090 585 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GNSP15586 552 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ITPKBP27987 946 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 IL12RB1P42701 662 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TUBP50607 506 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HLA-BQ31612 363 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 LAYNQ6UX15 382 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FAM35AQ86V20 835 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CACUL1Q86Y37 369 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FOXJ1Q92949 421 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BHMTQ93088 406 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GPR174Q9BXC1 333 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BBS2Q9BXC9 721 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SNX25Q9H3E2 840 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 OLFML3Q9NRN5 406 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PLK2Q9NYY3 685 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 EHD2Q9NZN4 543 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MARK1Q9P0L2 795 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KNL1Q8NG31 2342 aa8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 METTL12A8MUP2 240 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KCNK3O14649 394 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MDM4O15151 490 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TLR5O60602 858 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TNNC2P02585 160 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ZNF883P0CG24 379 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GAP43P17677 238 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GJB2P29033 226 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TPMTP51580 245 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CDH8P55286 799 aa8.43□□□□□ -1.06
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ORC1Q13415 861 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms