RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399207.5

SETD4-204, Transcript of SET domain containing 4, human

TSL 3 BASIC

Gene SETD4, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETD4-204	ENST00000399207	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	USP3	Q9Y6I4	520 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207		A0A1W2PQH9	124 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	CYP17A1	P05093	508 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	SETSIP	P0DME0	302 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	IRF1	P10914	325 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	PLA2G4A	P47712	749 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	MFAP3	P55082	362 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	PDE4C	Q08493	712 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	GAS6	Q14393	721 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	DHCR24	Q15392	516 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	RAB41	Q5JT25	222 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	TSSK4	Q6SA08	328 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	GBP6	Q6ZN66	633 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207		Q6ZS52	159 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	UBR7	Q8N806	425 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	THAP9	Q9H5L6	903 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207		O00370	1275 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	TBX18	O95935	607 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	ZBED1	O96006	694 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	EGF	P01133	1207 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	ADH5	P11766	374 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	KRT5	P13647	590 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	PGF	P49763	221 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	TKTL1	P51854	596 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	COG7	P83436	770 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	SATB1	Q01826	763 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	GAD2	Q05329	585 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	CNGA2	Q16280	664 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	HTR3D	Q70Z44	454 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	SCD5	Q86SK9	330 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	UBA3	Q8TBC4	463 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	NELL1	Q92832	810 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	OSER1	Q9NX31	292 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207		M0QYV0	167 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	MED7	O43513	233 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	RNF40	O75150	1001 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	APOD	P05090	189 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	HOXA6	P31267	233 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	OPRD1	P41143	372 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	KAT5	Q92993	513 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	ACD	Q96AP0	544 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	MED15	Q96RN5	788 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	PNKP	Q96T60	521 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	DCLK3	Q9C098	648 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	RAB23	Q9ULC3	237 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SETD4-204	ENST00000399207	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms