RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa26.57■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 NUDT5Q9UKK9 219 aa26.57■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 CAPN9O14815 690 aa26.57■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 PLD1Q13393 1074 aa26.57■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 ADAM32Q8TC27 787 aa26.57■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 KRT35Q92764 455 aa26.57■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 TBCBQ99426 244 aa26.57■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 TTLL2Q9BWV7 592 aa26.57■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 ZNF576Q9H609 170 aa26.57■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 DPYSL4O14531 572 aa26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 LRCH4O75427 683 aa26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 RFPL2O75678 378 aa26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 CSH1P0DML2 217 aa26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 CSH2P0DML3 217 aa26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 SSR1P43307 286 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 EPHB3P54753 998 aa26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 VEPH1Q14D04 833 aa26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 CCDC149Q6ZUS6 474 aa26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 GOLGA1Q92805 767 aa26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 CD101Q93033 1021 aa26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa26.56■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 MAN1A1P33908 653 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 SULT1E1P49888 294 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 TAF12Q16514 161 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 MON1AQ86VX9 555 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 FAM172AQ8WUF8 416 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 CEP295NLQ96MC4 621 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 TLE6Q9H808 572 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 LRG1P02750 347 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 TUBB4AP04350 444 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 NOS2P35228 1153 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 GJC1P36383 396 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 PTPN9P43378 593 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 NRIP1P48552 1158 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 BTBD8Q5XKL5 378 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 KIF18AQ8NI77 898 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 PSMG2Q969U7 264 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 HES6Q96HZ4 224 aa26.55■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa26.54■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 CCL16O15467 120 aa26.54■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 CXCR5P32302 372 aa26.54■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 SLC1A1P43005 524 aa26.54■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 LRIT3Q3SXY7 679 aa26.54■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 SLITRK1Q96PX8 696 aa26.54■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 NPY6RQ99463 290 aa26.54■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 COX16Q9P0S2 106 aa26.54■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 DOCK6Q96HP0 2047 aa26.54■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 RPS6KA1Q15418 735 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 SLC25A52Q3SY17 297 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 ALG3Q92685 438 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 ABCC13Q9NSE7 274 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 COMMD8Q9NX08 183 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 SRGAP2O75044 1071 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 MIPP30301 263 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 HDAC4P56524 1084 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 PPM1LQ5SGD2 360 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 ZNF697Q5TEC3 545 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 NT5C3BQ969T7 300 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 MYRFLQ96LU7 910 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 PCSK1NQ9UHG2 260 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 M0QYT0 321 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 TADA3O75528 432 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 RNF8O76064 485 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 IL1R2P27930 398 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 DUSP6Q16828 381 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 PEBP4Q96S96 227 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 LCMT1Q9UIC8 334 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 STAP1Q9ULZ2 295 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX15-202ENST00000377244 AMPD2Q01433 879 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 NME3Q13232 169 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 TAC4Q86UU9 113 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 HS6ST3Q8IZP7 471 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 KLHL11Q9NVR0 708 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 SNX12Q9UMY4 172 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 ZMYND10O75800 440 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 TBX18O95935 607 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 SMTNL2Q2TAL5 461 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 DCAF12L1Q5VU92 463 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX15-202ENST00000377244 SCYL2Q6P3W7 929 aa26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms