RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CPA4Q9UI42 421 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3CDO00329 1044 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 DACT2Q5SW24 774 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 VTA1Q9NP79 307 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 VPS28Q9UK41 221 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEB16A2A368 324 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 O00370 1275 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RHOCP08134 193 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CCR1P32246 355 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SOAT1P35610 550 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 AVPR1AP37288 418 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RAB27AP51159 221 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 KCNMA1Q12791 1236 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PLD3Q8IV08 490 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 MYO1HQ8N1T3 1032 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 BCL9O00512 1426 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF9O43307 516 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ALBP02768 609 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CPA3P15088 417 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 GLRBP48167 497 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CES2O00748 559 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TM9SF1O15321 606 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF286BP0CG31 522 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA13P48723 471 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ADCK1Q86TW2 530 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 FICDQ9BVA6 458 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ST3GAL1Q11201 340 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 HES6Q96HZ4 224 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 AP5Z1O43299 807 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH2P05091 517 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PRIM2P49643 509 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RHOAP61586 193 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RUNX1T1Q06455 604 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 GPAMQ9HCL2 828 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CYTH3O43739 400 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ILDR2Q71H61 639 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DDI1Q8WTU0 396 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DTNAQ9Y4J8 743 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CYP3A4P08684 503 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PAEPP09466 180 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 S100A5P33763 92 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TP53BP2Q13625 1128 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF284Q2VY69 593 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 MARC1Q5VT66 337 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 OOSP2Q86WS3 158 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PHF21AQ96BD5 680 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CCT7Q99832 543 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 YIPF2Q9BWQ6 316 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DCLK3Q9C098 648 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NOD2Q9HC29 1040 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 F8W810 466 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ACADSP16219 412 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TRPC1P48995 793 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 NT5MQ9NPB1 228 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TPST1O60507 370 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TOMM70O94826 608 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 GLP2RO95838 553 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PCYT1AP49585 367 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 HASPINQ8TF76 798 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 TLR10Q9BXR5 811 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 AQP5P55064 265 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.86■□□□□ 0.93
CCSAP-203ENST00000366687 RAP1GDS1P52306 607 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms