RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362913.1

SNORD56.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 68 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.1-201ENST00000362913 AP2B1P63010 937 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 SP2Q02086 613 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 MTAPQ13126 283 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 BIRC3Q13489 604 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 KCNJ12Q14500 433 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 LY6KQ17RY6 165 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 STYXQ8WUJ0 223 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 XAGE5Q8WWM1 108 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 R3HDM4Q96D70 268 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PDLIM2Q96JY6 352 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 HAPLN3Q96S86 360 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 RTKNQ9BST9 563 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TTPALQ9BTX7 342 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 SNX15Q9NRS6 342 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 LUZP4Q9P127 313 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 AMFRQ9UKV5 643 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 VWC2LB2RUY7 222 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 J3KTA2 159 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 AGPSO00116 658 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 FCHO1O14526 889 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM155BO75949 473 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ACTL6BO94805 426 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 LARGE1O95461 756 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PDHA1P08559 390 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 NPSP0C0P6 89 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM163BP0C2L3 166 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 CREB1P16220 341 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 NDUFB7P17568 137 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TNFRSF1AP19438 455 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TACR2P21452 398 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ADRA1DP25100 572 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 CST5P28325 142 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 NTSR1P30989 418 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ADRA1BP35368 520 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 GSTM5P46439 218 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 RENBPP51606 427 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 FHL3Q13643 280 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TBRG1Q3YBR2 411 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 NFRKBQ6P4R8 1299 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 Q6ZWC4 215 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRABD2AQ86V40 505 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 LRRC71Q8N4P6 559 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TFAP2BQ92481 460 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TBC1D5Q92609 795 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 GCC1Q96CN9 775 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 FSD1LQ9BXM9 530 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRDM8Q9NQV8 689 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 DUSP22Q9NRW4 184 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMLHEQ9NVH6 421 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 DKK3Q9UBP4 350 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 QSOX1O00391 747 aa3.02□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRIM38O00635 465 aa3.02□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 NPHP1O15259 732 aa3.02□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 DNPH1O43598 174 aa3.02□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 TAF5LO75529 589 aa3.02□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 TNFRSF6BO95407 300 aa3.02□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 FGAP02671 866 aa3.02□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 INSRRP14616 1297 aa3.02□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 MATN1P21941 496 aa3.02□□□□□ -1.93
SNORD56.1-201ENST00000362913 PCSK6P29122 969 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms