RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 YJEFN3A6XGL0 299 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 E7ENQ6 273 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 CHRNB1P11230 501 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 UCHL3P15374 230 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 GJA4P35212 333 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 CLCN1P35523 988 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 PSEN1P49768 467 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 GAB4Q2WGN9 574 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 MIB1Q86YT6 1006 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 BBS7Q8IWZ6 715 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 CPA6Q8N4T0 437 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 NELL2Q99435 816 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 RASAL2Q9UJF2 1139 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 SIK3Q9Y2K2 1263 aa28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 HELZP42694 1942 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 LGALS16A8MUM7 142 aa28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 H0Y858 1186 aa28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 CYP17A1P05093 508 aa28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 RALAP11233 206 aa28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 DAOAP59103 153 aa28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 KLHDC10Q6PID8 442 aa28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 SLC47A2Q86VL8 602 aa28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 FAM71AQ8IYT1 594 aa28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 LMAN1LQ9HAT1 526 aa28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 DNMT3LQ9UJW3 386 aa28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa28.32■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 MYH10P35580 1976 aa28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 E2F8A0AVK6 867 aa28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF165P49910 485 aa28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 NUBP1P53384 320 aa28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 EFEMP1Q12805 493 aa28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 PASD1Q8IV76 773 aa28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP18Q8N392 663 aa28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 EDEM1Q92611 657 aa28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 MIS12Q9H081 205 aa28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 CNGB3Q9NQW8 809 aa28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 TJP2Q9UDY2 1190 aa28.31■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 MED7O43513 233 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 NFATC1O95644 943 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 RPL34P49207 117 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 GAS6Q14393 721 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 IQCB1Q15051 598 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 DHCR24Q15392 516 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 SYCP1Q15431 976 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 FKBP15Q5T1M5 1219 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 FSTL4Q6MZW2 842 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 Q6ZS52 159 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 SCML4Q8N228 414 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF276Q8N554 614 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 WDTC1Q8N5D0 677 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 HSFY1Q96LI6 401 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 PLCB1Q9NQ66 1216 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 FAM86C1Q9NVL1 165 aa28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC10BA6NIK2 292 aa28.29■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 TPM2P07951 284 aa28.29■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 ANGPT1Q15389 498 aa28.29■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 BSPRYQ5W0U4 402 aa28.29■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1958Q8N8K9 716 aa28.29■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 PRRX2Q99811 253 aa28.29■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 ST7Q9NRC1 585 aa28.29■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 F5P12259 2224 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 F8VZ95 297 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 STC2O76061 302 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 HMBSP08397 361 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 RPS9P46781 194 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 PTPN5P54829 565 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 NHLH1Q02575 133 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 PTK2Q05397 1052 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 MEA1Q16626 185 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM196Q5HYL7 178 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 BTBD8Q5XKL5 378 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf228Q6PIY5 440 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 RHBDF2Q6PJF5 856 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 SLC4A5Q9BY07 1137 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 CHRDQ9H2X0 955 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 MUC6Q6W4X9 2439 aa28.28■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 NCAM2O15394 837 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 KLKB1P03952 638 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 PTMSP20962 102 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 OPRD1P41143 372 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 GALK1P51570 392 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 UBXN1Q04323 297 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 MTAPQ13126 283 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 PDCLQ13371 301 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 CCINQ13939 588 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms