RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 CALN1Q9BXU9 219 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 COX16Q9P0S2 106 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 USP3Q9Y6I4 520 aa21.43■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 NCAM1P13591 858 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 MAGEA11P43364 429 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 KRT81Q14533 505 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 PSMD5Q16401 504 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 IFT20Q8IY31 132 aa21.43■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 SCML4Q8N228 414 aa21.43■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 TEKT4Q8WW24 435 aa21.43■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 LRRC19Q9H756 370 aa21.43■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.42■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.42■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.42■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 EDEM1Q92611 657 aa21.42■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 C8orf48Q96LL4 319 aa21.42■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.42■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 DCLK3Q9C098 648 aa21.42■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 MTRRQ9UBK8 725 aa21.42■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 SOD2P04179 222 aa21.41■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 FNTAP49354 379 aa21.41■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 FAM131BQ86XD5 332 aa21.41■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 NT5C3BQ969T7 300 aa21.41■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 GDF3Q9NR23 364 aa21.41■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 SPG21Q9NZD8 308 aa21.41■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.41■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 RFX6Q8HWS3 928 aa21.41■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 HOMER3Q9NSC5 361 aa21.41■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 ADAM12O43184 909 aa21.4■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 HAUS1Q96CS2 278 aa21.4■■□□□ 1.02
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TRIM4-202ENST00000354241 ENDOD1O94919 500 aa21.39■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 VNN2O95498 520 aa21.39■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 MYBL2P10244 700 aa21.39■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 OR1D2P34982 312 aa21.39■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.02
TRIM4-202ENST00000354241 ROR1Q01973 937 aa21.39■■□□□ 1.02
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