RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 UBXN4Q92575 508 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 BADQ92934 168 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 H0Y3Z8 333 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LCP1P13796 627 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC6A3Q01959 620 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FPGSQ05932 587 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FUT10Q6P4F1 479 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CEP57Q86XR8 500 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MS4A14Q96JA4 679 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HSFY1Q96LI6 401 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 AGAP3Q96P47 875 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SMOQ99835 787 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 EHD2Q9NZN4 543 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ERLIN1O75477 346 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TADA3O75528 432 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CTAGE8P0CG41 777 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MARCKSL1P49006 195 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PEX5P50542 639 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CACNA2D1P54289 1103 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 COL19A1Q14993 1142 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PIGZQ86VD9 579 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KRT35Q92764 455 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RNF14Q9UBS8 474 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 USTQ9Y2C2 406 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 EFEMP2O95967 443 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FGBP02675 491 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PSMA2P25787 234 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LMAN1P49257 510 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RABGGTBP53611 331 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 BNIP1Q12981 228 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 EMC1Q8N766 993 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ALG3Q92685 438 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 B3GALT6Q96L58 329 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HHLA1C9JL84 531 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 F8VP50 259 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PSTPIP1O43586 416 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 OR4Q2P0C623 313 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GPD1P21695 349 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SCNN1AP37088 669 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PAFAH1B1P43034 410 aa6.32□□□□□ -1.4
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