RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 TMLHEQ9NVH6 421 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.65■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 CDK7P50613 346 aa18.64■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A52Q3SY17 297 aa18.64■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 FAM171BQ6P995 826 aa18.64■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.64■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 ACBD6Q9BR61 282 aa18.64■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 PCDH9Q9HC56 1237 aa18.64■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 OVOS1Q6IE37 1185 aa18.64■□□□□ 0.57
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ACTB-201ENST00000331789 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
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ACTB-201ENST00000331789 P3H4Q92791 437 aa18.64■□□□□ 0.57
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ACTB-201ENST00000331789 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 AP4E1Q9UPM8 1137 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 MCF2LO15068 1137 aa18.63■□□□□ 0.57
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ACTB-201ENST00000331789 NOMO1Q15155 1222 aa18.63■□□□□ 0.57
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ACTB-201ENST00000331789 SLC2A13Q96QE2 648 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 PKMYT1Q99640 499 aa18.63■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 MTMR10Q9NXD2 777 aa18.63■□□□□ 0.57
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ACTB-201ENST00000331789 FAM126BQ8IXS8 530 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 PYROXD2Q8N2H3 581 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 FAM71DQ8N9W8 422 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 FAF2Q96CS3 445 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 NPY6RQ99463 290 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TSPYL1Q9H0U9 437 aa18.62■□□□□ 0.57
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ACTB-201ENST00000331789 DPYSL2Q16555 572 aa18.62■□□□□ 0.57
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ACTB-201ENST00000331789 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 NT5C3BQ969T7 300 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 ZNF670Q9BS34 389 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 POPDC2Q9HBU9 364 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 HEY1Q9Y5J3 304 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 PTPRDP23468 1912 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TLDC2A0PJX2 215 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 SMIM23A6NLE4 172 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 H7C0C1 242 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 M0QYT0 321 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 PAX3P23760 479 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 ATP5OP48047 213 aa18.61■□□□□ 0.57
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