RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 CSPG5O95196 566 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 KLHL2O95198 593 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GARTP22102 1010 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 FSTL1Q12841 308 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SEPT6Q14141 434 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TREML1Q86YW5 311 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 EPAS1Q99814 870 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CLUHO75153 1309 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 A8MXQ7 604 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 OR6B1O95007 311 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 NPTXRO95502 500 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GMPRP36959 345 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CDC16Q13042 620 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 UBP1Q9NZI7 540 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CAP2P40123 477 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 AQP4P55087 323 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 OGDHQ02218 1023 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 PDK3Q15120 406 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 LIN52Q52LA3 116 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 EFHC2Q5JST6 749 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 USP33Q8TEY7 942 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CDRT15Q96T59 188 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TASP1Q9H6P5 420 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM165Q9HC07 324 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GJB1P08034 283 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 FGFR1P11362 822 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 KLRC2P26717 231 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 NME5P56597 212 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SLC12A1Q13621 1099 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 NFIL3Q16649 462 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 PPCSQ9HAB8 311 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 MTA2O94776 668 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 RALBP11234 206 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GNAZP19086 355 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CDKN2BP42772 138 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 OCRLQ01968 901 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 BANPQ8N9N5 519 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 KCNK16Q96T55 309 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SYT11Q9BT88 431 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GALNT8Q9NY28 637 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 E5RJQ4 531 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ENTPD3O75355 529 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 GPD1P21695 349 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 MMP8P22894 467 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 STAT5BP51692 787 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ESRRGP62508 458 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 NRG4Q8WWG1 115 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CATSPER2Q96P56 530 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 MED10Q9BTT4 135 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF536O15090 1300 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 PEX10O60683 326 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CRCPO75575 148 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CXCL8P10145 99 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 TAP1Q03518 808 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 PPM1JQ5JR12 505 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF862O60290 1169 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ERVK-10P10266 1014 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SPDYAQ5MJ70 313 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms