RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 DCDC2Q9UHG0 476 aa20.89■□□□□ 0.94
USP25-202ENST00000285681 DEPDC5O75140 1603 aa20.89■□□□□ 0.94
USP25-202ENST00000285681 YWHAQP27348 245 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 E2F4Q16254 413 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 MARC1Q5VT66 337 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 POTEAQ6S8J7 498 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ACTL9Q8TC94 416 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 CCDC126Q96EE4 140 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 GRIK5Q16478 980 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 MYO1HQ8N1T3 1032 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 CERS5Q8N5B7 392 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 DISP2A7MBM2 1401 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 MSCO60682 206 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 PAEPP09466 180 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 LSP1P33241 339 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ADAM2Q99965 735 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.89■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ZBTB39O15060 712 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SERPINB11Q96P15 392 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 PORCNQ9H237 461 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ZNF556Q9HAH1 456 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 RAMP2O60895 175 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 DDHD2O94830 711 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ILDR2Q71H61 639 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 FAM162AQ96A26 154 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 NRCAMQ92823 1304 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 B2RBV5 119 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 LONP2Q86WA8 852 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 KAT2BQ92831 832 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 RBBP8Q99708 897 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 THTPAQ9BU02 230 aa20.88■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 VGLL3A8MV65 326 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 MYO1GB0I1T2 1018 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 KRT34O76011 436 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 RARGP13631 454 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ABHD8Q96I13 439 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 MICAL2O94851 1124 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SERPINF2P08697 491 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SLC12A3P55017 1021 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 DMC1Q14565 340 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 CDH8P55286 799 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SKOR1P84550 965 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 RECQL4O94761 1208 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 TP53BP2Q13625 1128 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 CLEC4FQ8N1N0 589 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 PNKPQ96T60 521 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 GAD1Q99259 594 aa20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 TBC1D12O60347 775 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 GLP2RO95838 553 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 TM4SF1P30408 202 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 SOX11P35716 441 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 RENBPP51606 427 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 CNGA3Q16281 694 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 MTMR9Q96QG7 549 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 TRIM16O95361 564 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 FAM107AO95990 144 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 HLA-DPA1P20036 260 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 DNAJC3Q13217 504 aa20.86■□□□□ 0.93
USP25-202ENST00000285681 TUBGCP3Q96CW5 907 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms