RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 CFAP97Q9P2B7 532 aa23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 GFPT2O94808 682 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 SOX5P35711 763 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 SOX9P48436 509 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 TPRG1Q6ZUI0 275 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 PASD1Q8IV76 773 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 SCUBE3Q8IX30 993 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 TTC16Q8NEE8 873 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 EPS8L1Q8TE68 723 aa23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQC6 194 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 FYNP06241 537 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 GLULP15104 373 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 PBX1P40424 430 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 CLCN5P51795 746 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 PDCLQ13371 301 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 FZD5Q13467 585 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 RUNX3Q13761 415 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 FILIP1LQ4L180 1135 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 C10orf120Q5SQS8 335 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 TMEM105Q8N8V8 129 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 FLCNQ8NFG4 579 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 IRGQQ8WZA9 623 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 CPXM1Q96SM3 734 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 FOXQ1Q9C009 403 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 MIS12Q9H081 205 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 TSPY26PQ9H489 355 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 ST7Q9NRC1 585 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 DNMT3LQ9UJW3 386 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 PIAS3Q9Y6X2 628 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 KMT2EQ8IZD2 1858 aa23.37■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 KANSL1LA0AUZ9 987 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 E5RJQ4 531 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 SERPINC1P01008 464 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 RALAP11233 206 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 CHRNB2P17787 502 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 AVPR2P30518 371 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 KRT9P35527 623 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 STAT1P42224 750 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 ACADSBP45954 432 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 ZNF445P59923 1031 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 PDGFRLQ15198 375 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 TXNDC11Q6PKC3 985 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 BAP1Q92560 729 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 SHDQ96IW2 340 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 MFSD1Q9H3U5 465 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 WDFY4Q6ZS81 3184 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 MYOFQ9NZM1 2061 aa23.36■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 E2F8A0AVK6 867 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 FBXO21O94952 628 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 AOC1P19801 751 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 TAF3Q5VWG9 929 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 HTR3DQ70Z44 454 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 SLC20A1Q8WUM9 679 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 EDEM1Q92611 657 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 SPAG5Q96R06 1193 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 ECT2Q9H8V3 914 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 LTB4R2Q9NPC1 389 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa23.35■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 MMEP08473 750 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 CTHP32929 405 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 TPM4P67936 248 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 EFEMP1Q12805 493 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 GAB4Q2WGN9 574 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 NACA2Q9H009 215 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.34■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 STC2O76061 302 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 LTFP02788 710 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 KLKB1P03952 638 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 IFNAR2P48551 515 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 UBASH3AP57075 661 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 FMO1Q01740 532 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 ZNF852Q6ZMS4 543 aa23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms