RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 C2CD2LO14523 706 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 LCA5LO95447 670 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 HIST1H2ADP20671 130 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 PTPN7P35236 360 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 RARRES1P49788 294 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 RAP1GDS1P52306 607 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 ACAP1Q15027 740 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 RASGEF1CQ8N431 466 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 RXFP2Q8WXD0 754 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 HIST1H2AJQ99878 128 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 H2AFJQ9BTM1 129 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 NFIBO00712 420 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 VCAM1P19320 739 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 GRTP1Q5TC63 336 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 LRRC38Q5VT99 294 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 RRM2BQ7LG56 351 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 VGLL2Q8N8G2 317 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 STKLD1Q8NE28 680 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 UBDO15205 165 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 ADARP55265 1226 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF280CQ8ND82 737 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 MYOM1P52179 1685 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC15Q0P6D6 951 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 PRMT9Q6P2P2 845 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 PXDNQ92626 1479 aa19.13■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 A0A087WXM4 84 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 PCSK1P29120 753 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 MARSP56192 900 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 IL17AQ16552 155 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 QPCTQ16769 361 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 TTC23LQ6PF05 361 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 OTOP1Q7RTM1 612 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF333Q96JL9 665 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 AP4E1Q9UPM8 1137 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 ENTPD5O75356 428 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 APOC2P02655 101 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 CDC25CP30307 473 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 CHN2P52757 468 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 PCSK7Q16549 785 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 CHST13Q8NET6 341 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 KCTD10Q9H3F6 313 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 RABGEF1Q9UJ41 708 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 BCL10O95999 233 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 TTKP33981 857 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 ATP6V1E1P36543 226 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 C16orf72Q14CZ0 275 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 MFSD5Q6N075 450 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 MPZL3Q6UWV2 235 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 SZRD1Q7Z422 152 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 EMC1Q8N766 993 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 POU5F2Q8N7G0 328 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 CASP10Q92851 521 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 KLHL25Q9H0H3 589 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 V9GYQ6 96 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 MEGF6O75095 1541 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 AGKQ53H12 422 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 TBCELQ5QJ74 424 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 MRNIPQ6NTE8 343 aa19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 MAP3K6O95382 1288 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 F9P00740 461 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 POU4F1Q01851 419 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 MMRN1Q13201 1228 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 EFCAB12Q6NXP0 572 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 MROH2AA6NES4 1674 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 FSCN2O14926 492 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 PROCP04070 461 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 SOX11P35716 441 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC81Q6ZN84 652 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 ERO1BQ86YB8 467 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 SLC22A9Q8IVM8 553 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 STX19Q8N4C7 294 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 LRRC71Q8N4P6 559 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC28BQ9BUN5 200 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 M0QYT0 321 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 NCAM2O15394 837 aa19.11■□□□□ 0.65
HOXA13-201ENST00000222753 DDHD2O94830 711 aa19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms