RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC106Q9BWC9 280 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SMIM24O75264 130 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNA3P22001 575 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 PLD5Q8N7P1 536 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF149Q8NC42 400 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 ACAP3Q96P50 834 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3GL3Q99963 347 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.99■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEA13PA6NCF6 341 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNN4O15554 427 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP3K13O43283 966 aa22.98■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 CHI3L2Q15782 390 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.98■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 KBTBD2Q8IY47 623 aa22.98■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 C2CD4BA6NLJ0 364 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 C19orf81C9J6K1 198 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 BIRC5O15392 142 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT38O76015 456 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 ORC1Q13415 861 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 GSTA3Q16772 222 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 TRNP1Q6NT89 227 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 KLC2Q9H0B6 622 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.98■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 HMGCRP04035 888 aa22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 TGM2P21980 687 aa22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 IL4RP24394 825 aa22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 CRHR1P34998 444 aa22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 C1orf21Q9H246 121 aa22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.97■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 IL18RAPO95256 599 aa22.96■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEA3P43357 314 aa22.96■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 FAM167AQ96KS9 214 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 PICK1Q9NRD5 415 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 ACKR2O00590 384 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 CYB561D2O14569 222 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 PRPSAP2O60256 369 aa22.96■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 ANPEPP15144 967 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 RBL1P28749 1068 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 DCAF15Q66K64 600 aa22.96■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 ULK2Q8IYT8 1036 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 PQLC3Q8N755 202 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP120Q8N960 986 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 PANX3Q96QZ0 392 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 FZD8Q9H461 694 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SPON1Q9HCB6 807 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.96■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM159BA6NKW6 160 aa22.95■■□□□ 1.27
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