RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 FKTNO75072 461 aa24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXO21O94952 628 aa24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 IL4RP24394 825 aa24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 GRK4P32298 578 aa24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 BRCC3P46736 316 aa24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 GNGT1P63211 74 aa24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 GLB1LQ6UWU2 654 aa24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 PGM2Q96G03 612 aa24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 SMARCD1Q96GM5 515 aa24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 SHOC2Q9UQ13 582 aa24.95■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 H7C0C1 242 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 RASGRF2O14827 1237 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 NOS2P35228 1153 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP5OP48047 213 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 NDUFV1P49821 464 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 DPYSL2Q16555 572 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 UNC45BQ8IWX7 931 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 PLD5Q8N7P1 536 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM71DQ8N9W8 422 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 HEY1Q9Y5J3 304 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.94■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF487B1APH4 448 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 EOMESO95936 686 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 RELL1Q8IUW5 271 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 SMOQ99835 787 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ACBD6Q9BR61 282 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 NINJ2Q9NZG7 142 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 TSC2P49815 1807 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 KBTBD13C9JR72 458 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CYP11A1P05108 521 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 L1CAMP32004 1257 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 POPDC2Q9HBU9 364 aa24.93■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CAPN9O14815 690 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CYP2F1P24903 491 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 YY1P25490 414 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGEA4P43358 317 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 SLCO1A2P46721 670 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 IRAK1P51617 712 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC9A4Q6AI14 798 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 PPIL6Q8IXY8 311 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 THEM5Q8N1Q8 247 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC185Q8N715 623 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 PQLC3Q8N755 202 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 MYLPFQ96A32 169 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNK16Q96T55 309 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ULBP1Q9BZM6 244 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 SAYSD1Q9NPB0 183 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 C9IYK1 514 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 M0QZQ0 153 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ARVCFO00192 962 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 VEGFBP49765 207 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 PRMT2P55345 433 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP2R2AP63151 447 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM131BQ86XD5 332 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 TLCD1Q96CP7 247 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 FAF2Q96CS3 445 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CNGB3Q9NQW8 809 aa24.92■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 MBTPS1Q14703 1052 aa24.91■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.91■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 URGCPQ8TCY9 931 aa24.91■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 C9orf72Q96LT7 481 aa24.91■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.91■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa24.91■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 INPPL1O15357 1258 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 RABGGTBP53611 331 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 CENPUQ71F23 418 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC2A13Q96QE2 648 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 COX16Q9P0S2 106 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 M0QYT0 321 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 AGTP01019 485 aa24.9■■□□□ 1.58
RPUSD1-201ENST00000007264 ARL4AP40617 200 aa24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms