RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PtprcP06800 1291 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 UmpsP13439 481 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 IppP28575 584 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfyve27Q3TXX3 415 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mpzl3Q3V3F6 237 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Xlr3aQ60595 226 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gbp9Q8BTS3 619 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vps37bQ8R0J7 285 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Epn3Q91W69 636 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dpp3Q99KK7 738 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MutyhQ99P21 515 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Psmd8Q9CX56 353 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rmi1Q9D4G9 616 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Actrt1Q9D9J3 376 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp5hQ9DCX2 161 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Copg2Q9QXK3 871 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Scnn1bQ9WU38 638 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AspgA0JNU3 564 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ptpn3A2ALK8 913 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr310B2RVZ1 332 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt13P08730 437 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klrb1bP27812 223 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 OtulinQ3UCV8 352 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttc9Q3V038 219 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pdp2Q504M2 532 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Capn3Q64691 821 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif11Q6P9P6 1052 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mtss1Q8R1S4 759 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdhb1Q91Y08 818 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kdelr1Q99JH8 212 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Map4k3Q99JP0 894 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q9CPS8 106 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arhgap8Q9CXP4 425 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MsraQ9D6Y7 233 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ankfn1A0A140LIW7 1083 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zc3h7aE9PWW6 970 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccr5P51682 354 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc17a7Q3TXX4 560 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp90Q61967 636 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ntan1Q64311 310 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tpp2Q64514 1262 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bnip1Q6QD59 228 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NfascQ810U3 1240 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TdrpQ8C5P7 182 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sorcs3Q8VI51 1219 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tomm20lQ9D4V6 152 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Xpo7Q9EPK7 1087 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif9Q9WV04 790 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdr1E9Q0B4 517 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp27b1O35084 507 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hexim2Q3TVI4 313 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PapolaQ61183 739 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Map3k7Q62073 579 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Crybg3Q80W49 1005 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tspan18Q80WR1 248 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PimregQ8BFY7 231 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lrrc19Q8BZT5 364 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atg16l1Q8C0J2 607 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kctd12bQ8C7J6 292 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmco4Q91WU4 631 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pbx4Q99NE9 378 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MlklQ9D2Y4 472 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pck1Q9Z2V4 622 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gon4lQ9DB00 2260 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smok3aC0HKC8 504 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smok3bC0HKC9 504 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 VdrP48281 422 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tff2Q03404 129 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 InhbaQ04998 424 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrkciQ62074 595 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tfdp2Q64163 446 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wdtc1Q80ZK9 677 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr20Q8BYC4 358 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mgat5Q8R4G6 740 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Asb7Q91ZU0 318 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gps1Q99LD4 471 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Trem2Q99NH8 227 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r103E9PWW0 856 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Apol11aE9PZG0 334 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Galnt4O08832 578 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AmhP27106 555 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Irs1P35569 1233 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stmn1P54227 149 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Stx2Q00262 289 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.1 ms