RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047207.6

Ccdc27-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc27, Length 2,089 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Necab2Q91ZP9 389 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ecrg4Q99LS0 148 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Trem2Q99NH8 227 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tspan17Q9D7W4 270 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 PllpQ9DCU2 182 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Krt7Q9DCV7 457 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Myoz2Q9JJW5 264 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Rfx5Q9JL61 658 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Asap1Q9QWY8 1147 aa14.6□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f15A0A087WR44 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f12A0A0A0MQP3 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f9A2BFZ7 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f7A2BHG6 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f19A2CG71 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f10A2CG92 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f3A2CGC2 496 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f13B8JKF6 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 NuggcD3YWJ0 796 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cyp2t4E9PWV0 503 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f2J3QMS5 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f25J3QMV9 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f6J3QMW9 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f26J3QNK2 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f24J3QNQ5 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f8J3QQ50 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gm3383J3QQ59 259 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f17L7MU81 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f18L7MU83 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gm3164L7N2B9 238 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gm3239L7N2D9 227 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Bmpr2O35607 1038 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Hcn2O88703 863 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 InvsO89019 1062 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 ChgbP16014 677 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 RarbP22605 482 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 PkmP52480 531 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Rab6bP61294 208 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Sh3bp2Q06649 559 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f14Q1LZI5 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pcnx4Q3UVY5 1174 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Zfp956Q3UZY6 572 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ttc9Q3V038 219 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Btbd35f27Q5FWA1 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cand1Q6ZQ38 1230 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 ItpkcQ7TS72 678 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cgrrf1Q8BMJ7 332 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ccdc159Q8C963 411 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Rab15Q8K386 212 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 GMCL1P1Q99N64 498 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Commd8Q9CZG3 183 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 CabyrQ9D424 453 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Vwa7Q9JHA8 891 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Trpm5Q9JJH7 1158 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 TfebQ9R210 475 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Dicer1Q8R418 1916 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 UprtB1AVZ0 310 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gm28043E0CXC2 719 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pik3r2O08908 722 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Mllt10O54826 1068 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cd2P08920 344 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gsta4P24472 222 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cdh5P55284 784 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Fitm2P59266 262 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Grm1P97772 1199 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gm29609Q3UU56 907 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Wdr18Q4VBE8 431 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 LbpQ61805 481 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ptpn14Q62130 1189 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Rexo4Q6PAQ4 432 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Chst10Q6PGK7 356 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Znf507Q6ZPY5 941 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tas2r102Q7M717 329 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pqlc1Q80XM9 271 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gtf3c2Q8BL74 907 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tcaf1Q8BNE1 924 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Creb5Q8K1L0 357 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Mtss1Q8R1S4 759 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Slc39a3Q99K24 317 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ttc30bQ9CY00 664 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Actrt2Q9D9L5 377 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 ParvbQ9ES46 365 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gyg1Q9R062 333 aa14.59□□□□□ -0.07
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Psme4Q5SSW2 1843 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 A0A1Y7VP24 259 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pgap3A2A559 320 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 PiggD3Z3Y1 983 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gm3415J3QMS8 315 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gm43302L7N1X8 611 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 EpoP07321 192 aa14.58□□□□□ -0.08
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.8 ms