RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041055.8

Atg2b-201, Transcript of Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Atg2b, Length 7,546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2b-201ENSMUST00000041055 SprtnG3X912 497 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm379J3QQ19 296 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tnfrsf11bO08712 401 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Vti1bO88384 232 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 En2P09066 324 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cct8P42932 548 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CamkvQ3UHL1 512 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tssk1bQ61241 365 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slfnl1Q8BHW9 410 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tmtc3Q8BRH0 920 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Olfr1414Q8VGU5 312 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tmem86aQ9D8N3 241 aa12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ruvbl2Q9WTM5 463 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 RerglB2RVE2 204 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Wdr72D3YYM4 1114 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prl2c3P04768 224 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lta4hP24527 611 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 NcstnP57716 708 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Sec23aQ01405 765 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Hesx1Q61658 185 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gadl1Q80WP8 550 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lamtor4Q8CF66 99 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Asb7Q91ZU0 318 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Abtb1Q99LJ2 478 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gpn3Q9D3W4 284 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 AspgA0JNU3 564 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Acot1O55137 419 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tal1P22091 329 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Krt6aP50446 553 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slc16a10Q3U9N9 512 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Nsl1Q8K305 281 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CerkQ8K4Q7 531 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 TraipQ8VIG6 470 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 2010005H15RikQ9D8D6 97 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pold2O35654 469 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Xirp1O70373 1129 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Foxd1Q61345 456 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ssxb5Q6XAS2 159 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 NrcamQ810U4 1256 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Entpd3Q8BFW6 529 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Brd8Q8R3B7 951 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Aipl1Q924K1 328 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Trap1Q9CQN1 706 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 LrmdaQ9D9B4 229 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Flvcr1B2RXV4 560 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zfp358E9Q8M1 571 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm7942L7N277 499 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tespa1Q3U132 458 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Sema5aQ62217 1077 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 GabrqQ9JLF1 638 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 RhoaQ9QUI0 193 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 JundP15066 341 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fgfr1P16092 822 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Phactr1Q2M3X8 580 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 1810065E05RikQ5NC41 235 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Frmd5Q6P5H6 517 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Sel1l3Q80TS8 1137 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prpf18Q8BM39 342 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm8267E9Q207 261 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm7535F7CXE4 302 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 GsapQ3TCV3 858 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 FaxcQ3UMF9 409 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Atp4aQ64436 1033 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 VcpkmtQ8C436 228 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zdhhc12Q8VC90 267 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 NlnQ91YP2 704 aa12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Abt1Q9QYL7 269 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 FanceB8JJD6 213 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Klra1P20937 262 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Olfr412Q7TRW7 312 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Alg9Q8VDI9 611 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Inpp4aQ9EPW0 939 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zbed6D2EAC2 980 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Vps50Q8CI71 964 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Wdsub1Q9D0I6 474 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rag1P15919 1040 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Aldh1a1P24549 501 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Itga4Q00651 1039 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slc38a5Q3U1J0 479 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Krt72Q6IME9 520 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tmem169Q8BG50 297 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tldc1Q8K0P3 455 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 MyripQ8K3I4 856 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Duoxa2Q9D311 320 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Taf1dQ9D4V4 322 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm3095E9Q058 166 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Mmp13P33435 472 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Oog3Q3UWY1 500 aa12.88□□□□□ -0.35
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Bcar1Q61140 874 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22 ms