RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eftud2O08810 971 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dmp1O55188 503 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Elk3P41971 409 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PuraP42669 321 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nuak1Q641K5 658 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stk40Q7TNL3 435 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pnma2Q8BHK0 365 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Phactr3Q8BYK5 558 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Proser2Q8C5R2 471 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mkl1Q8K4J6 964 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pdik1lQ8QZR7 341 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plekhh3Q8VCE9 796 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pex6Q99LC9 981 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fuca1Q99LJ1 452 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CoprsQ9CQ13 173 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 VasnQ9CZT5 673 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TtpalQ9D3D0 343 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rmi1Q9D4G9 616 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9DA42 136 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp94E9Q6Y4 486 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mup13L7N222 235 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acot1O55137 419 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hnrnph2P70333 449 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lig3P97386 1015 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppp1r1bQ60829 194 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 OcrlQ6NVF0 900 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cand1Q6ZQ38 1230 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gsto2Q8K2Q2 248 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam114a2Q8VE88 497 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PlvapQ91VC4 438 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slamf8Q9D3G2 278 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cep83Q9D5R3 692 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gabbr1Q9WV18 960 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5538W4VSP6 401 aa10.63□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r121A2BE32 847 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1354E9Q5G9 310 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm20503G3UZK1 150 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AgxtO35423 414 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab21P35282 222 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Oprl1P35377 367 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sar1aP36536 198 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Msx3P70354 204 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adamts1P97857 968 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EnahQ03173 802 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf746Q3U133 652 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ripor1Q68FE6 1223 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MregQ6NVG5 214 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q8BHN7 327 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chmp2bQ8BJF9 213 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc39a13Q8BZH0 361 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prpf39Q8K2Z2 665 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DarsQ922B2 501 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NelfcdQ922L6 591 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kdm8Q9CXT6 414 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dcp2Q9CYC6 422 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tspan17Q9D7W4 270 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab27aQ9ERI2 221 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hes6Q9JHE6 224 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc86Q9JJ89 426 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 XntrpcF8VQM8 1264 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3164L7N2B9 238 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3264L7N2C5 238 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EgfP01132 1217 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GckP52792 465 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab6bP61294 208 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 YwhazP63101 245 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PhbP67778 272 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krt77Q6IFZ6 572 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnajc8Q6NZB0 253 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Xpo1Q6P5F9 1071 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnv1Q8BZN2 503 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Iqsec1Q8R0S2 961 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sgip1Q8VD37 806 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr30Q8VGD8 315 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FcrlaQ920A9 352 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pard3bQ9CSB4 1203 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LgmnO89017 435 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnj6P48542 425 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcsk1P63239 753 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptcd3Q14C51 685 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gbp8Q2V6D6 525 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc17a7Q3TXX4 560 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Smcr8Q3UMB5 935 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ddx4Q61496 702 aa10.62□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.3 ms