RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	TSPAN4	O14817	238 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	OGT	O15294	1046 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PGM3	O95394	542 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	HMBS	P08397	361 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	NR2F2	P24468	414 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GUCY1A3	Q02108	690 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GRB14	Q14449	540 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MFSD10	Q14728	455 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	KYNU	Q16719	465 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SGO2	Q562F6	1265 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TPGS2	Q68CL5	300 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SESTD1	Q86VW0	696 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	DCLK2	Q8N568	766 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	REPS2	Q8NFH8	660 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TBATA	Q96M53	351 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751		A0A1W2PQ72	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ETS2	P15036	469 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	AKR1B1	P15121	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF18	P17022	549 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CYP11B2	P19099	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GNG11	P61952	73 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	STARD3	Q14849	445 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	EMC2	Q15006	297 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	HPS1	Q92902	700 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PIGS	Q96S52	555 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MEI4	A8MW99	385 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GLI1	P08151	1106 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	NRL	P54845	237 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	HSPH1	Q92598	858 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	THRSP	Q92748	146 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	COG5	Q9UP83	839 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751		H3BRJ5	948 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	BRAF	P15056	766 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	C4BPB	P20851	252 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CCNE1	P24864	410 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ACD	Q96AP0	544 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61

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