RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN10Q9HC96 672 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1586Q9HCI6 787 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP8B1Q9UNU6 501 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP13Q12802 2813 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP8B3O60423 1300 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SYPP08247 313 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 NTSR1P30989 418 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF423Q2M1K9 1284 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf34Q49A92 452 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SDE2Q6IQ49 451 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 RGL4Q8IZJ4 473 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNV2Q8TDN2 545 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 OVCA2Q8WZ82 227 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPA12BQ96MM6 686 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SPHK2Q9NRA0 654 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA1EQ15878 2313 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP33O14559 1287 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CST3P01034 146 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPC3Q13507 836 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 GRAMD4Q6IC98 578 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CHPFQ8IZ52 775 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIML1Q8N9V2 468 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 GLIS3Q8NEA6 775 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 HPS3Q969F9 1004 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC127Q96BQ5 260 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
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CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM24O15164 1050 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF217O75362 1048 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM25Q86YD3 366 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 PDILTQ8N807 584 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CGRRF1Q99675 332 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC5A3P53794 718 aa29.02■■■□□ 2.24
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CAPNS1-217ENST00000629983 MIB1Q86YT6 1006 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SCAMP5Q8TAC9 235 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNK16Q96T55 309 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 GMIPQ9P107 970 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRDP23468 1912 aa29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087X0B3 334 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM163BP0C2L3 166 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CD59P13987 128 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFV2P19404 249 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2J2P51589 502 aa29.01■■■□□ 2.23
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SCFD1Q8WVM8 642 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMK1GQ96NX5 476 aa29.01■■■□□ 2.23
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CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQD8 194 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQF6 199 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3BP5O60239 455 aa29■■■□□ 2.23
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CAPNS1-217ENST00000629983 FAM173BQ6P4H8 233 aa29■■■□□ 2.23
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CAPNS1-217ENST00000629983 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ACOX2Q99424 681 aa29■■■□□ 2.23
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CAPNS1-217ENST00000629983 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
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CAPNS1-217ENST00000629983 RAD54BQ9Y620 910 aa28.99■■■□□ 2.23
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CAPNS1-217ENST00000629983 GNSP15586 552 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ASIC1P78348 528 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SCAPQ12770 1279 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TPGS1Q6ZTW0 290 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCD1Q96GM5 515 aa28.97■■■□□ 2.23
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