RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615959.1

MIR3648-1-201, Transcript of microRNA 3648-1, humanhuman

BASIC

Gene MIR3648-1, Length 180 nt, Biotype miRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR3648-1-201ENST00000615959 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 EML5Q05BV3 1969 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 STX10O60499 249 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 RPP40O75818 363 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 SMC2O95347 1197 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 SDHBP21912 280 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 DMC1Q14565 340 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 FBXL13Q8NEE6 735 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 USP33Q8TEY7 942 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 OTUB2Q96DC9 234 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 DNAI2Q9GZS0 605 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 PNPLA8Q9NP80 782 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 RAB20Q9NX57 234 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 SCML2Q9UQR0 700 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa27.12■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 TLR5O60602 858 aa27.11■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 ADH1CP00326 375 aa27.11■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 SLC6A11P48066 632 aa27.11■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 MXI1P50539 228 aa27.11■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 TIGD1Q96MW7 591 aa27.11■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 NACA2Q9H009 215 aa27.11■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 AXIN1O15169 862 aa27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 ADH5P11766 374 aa27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 C2orf27AQ580R0 203 aa27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 ANKRD40Q6AI12 368 aa27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 SMARCE1Q969G3 411 aa27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 PNKPQ96T60 521 aa27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 TSG101Q99816 390 aa27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 SEMA4GQ9NTN9 838 aa27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 EBF1Q9UH73 591 aa27.1■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 A0A0A0MRY4 1105 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 APBB3O95704 486 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 CCDC192P0DO97 292 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 ACO1P21399 889 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 SEC13P55735 322 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 CSRP2Q16527 193 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZNF394Q53GI3 561 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 LY6G5CQ5SRR4 150 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 C12orf40Q86WS4 652 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 TTC39CQ8N584 583 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 WBP2Q969T9 261 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 JAKMIP2Q96AA8 810 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 DUSP16Q9BY84 665 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 CYLDQ9NQC7 956 aa27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 ANTXRLA6NF34 631 aa27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 CYP26A1O43174 497 aa27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 TBX18O95935 607 aa27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 PMS1P54277 932 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 GAD2Q05329 585 aa27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 MESP2Q0VG99 397 aa27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 KBTBD6Q86V97 674 aa27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 BBS7Q8IWZ6 715 aa27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 TATDN2Q93075 761 aa27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 LOXL4Q96JB6 756 aa27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 CISHQ9NSE2 258 aa27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 OSER1Q9NX31 292 aa27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
MIR3648-1-201ENST00000615959 KAT7O95251 611 aa27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 APODP05090 189 aa27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 KIF11P52732 1056 aa27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 CBWD6Q4V339 395 aa27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 CBWD3Q5JTY5 395 aa27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 CBWD5Q5RIA9 395 aa27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 TCERG1LQ5VWI1 586 aa27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 SFTPA1Q8IWL2 248 aa27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 NMUR1Q9HB89 426 aa27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 COQ4Q9Y3A0 265 aa27.07■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 IRF1P10914 325 aa27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 GRIA2P42262 883 aa27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 LRRC63Q05C16 580 aa27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 PRR23CQ6ZRP0 262 aa27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 HTR3DQ70Z44 454 aa27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 SLC4A11Q8NBS3 891 aa27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 TMEM176AQ96HP8 235 aa27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 ARID3AQ99856 593 aa27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 ARHGEF4Q9NR80 690 aa27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 SPHK2Q9NRA0 654 aa27.06■■□□□ 1.92
MIR3648-1-201ENST00000615959 MMP17Q9ULZ9 603 aa27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms