RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 RIN3Q8TB24 985 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 E2F7Q96AV8 911 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 STK33Q9BYT3 514 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TSPY26PQ9H489 355 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 C11orf16Q9NQ32 467 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TDP1Q9NUW8 608 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 OSER1Q9NX31 292 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 OBP2AQ9NY56 170 aa11.93□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 COL4A2P08572 1712 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 MED7O43513 233 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SERPINC1P01008 464 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CKMP06732 381 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L7P0C7H9 530 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PFKLP17858 780 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 GPD2P43304 727 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TUBP50607 506 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TKTL1P51854 596 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 JAM2P57087 298 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF445P59923 1031 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TPM4P67936 248 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ZXDBP98169 803 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PTK2Q05397 1052 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 NR1I3Q14994 352 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 MEA1Q16626 185 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 FILIP1LQ4L180 1135 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ASIC4Q96FT7 647 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 NMUR1Q9HB89 426 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.92□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TK2O00142 265 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 DPYSL4O14531 572 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 COCHO43405 550 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP11B1P15538 503 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 RGS7P49802 495 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PDE6CP51160 858 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC7A9P82251 487 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 FANCCQ00597 558 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ADIGQ0VDE8 80 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 HECTD3Q5T447 861 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PM20D1Q6GTS8 502 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 BHLHA9Q7RTU4 235 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SCD5Q86SK9 330 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 NEK11Q8NG66 645 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ULBP1Q9BZM6 244 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CYLDQ9NQC7 956 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 WNT16Q9UBV4 365 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.91□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1W2PQH9 124 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM86C2PA6NEL3 165 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ARNTLO00327 626 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PIK3R2O00459 728 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TLR5O60602 858 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ZBED1O96006 694 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 GDI1P31150 447 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SOX5P35711 763 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 RPL34P49207 117 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 BPIFB4P59827 614 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 COL4A3Q01955 1670 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF77Q15935 545 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 EPS8L1Q8TE68 723 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 HSFY1Q96LI6 401 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 BRD9Q9H8M2 597 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 CPQQ9Y646 472 aa11.9□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1W2PQC6 194 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 KRBA1A5PL33 1030 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM221A6NGB7 291 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 M0R296 226 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF263O14978 683 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 CHADO15335 359 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR37L1O60883 481 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 GFPT2O94808 682 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TBX18O95935 607 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 RARGP13631 454 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 LCP1P13796 627 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TCF3P15923 654 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 UBASH3AP57075 661 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms