RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	RAD54L	Q92698	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MYH8	P13535	1937 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DVL2	O14641	736 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CETN3	O15182	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PLA2G6	O60733	806 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CLSTN1	O94985	981 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	LCA5L	O95447	670 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	AKR1B1	P15121	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GAP43	P17677	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	INHBE	P58166	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	STK4	Q13043	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CLUL1	Q15846	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289		Q4G0T1	1027 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	STAM	Q92783	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR24	Q96S15	920 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PRRX2	Q99811	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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