RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581598.1

CCDC42-203, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC42, Length 538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-203ENST00000581598 TIGD1Q96MW7 591 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 TWNKQ96RR1 684 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 RMND1Q9NWS8 449 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 GMIPQ9P107 970 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 A0A0A0MRY4 1105 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 AXIN1O15169 862 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 APBB3O95704 486 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 FAM200BP0CF97 657 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 GSDMAQ96QA5 445 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 RTKNQ9BST9 563 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 HHLA1C9JL84 531 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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CCDC42-203ENST00000581598 PNOCQ13519 176 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 TTC39CQ8N584 583 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 WHAMMQ8TF30 809 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 HHIPQ96QV1 700 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 PNKPQ96T60 521 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CYLDQ9NQC7 956 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 SCML2Q9UQR0 700 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CETN3O15182 167 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 STX10O60499 249 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 TLR5O60602 858 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 EPN2O95208 641 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CCDC192P0DO97 292 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 ADH5P11766 374 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 ADORA2BP29275 332 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 SPATA20Q8TB22 786 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 NETO1Q8TDF5 533 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 APODP05090 189 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 MXI1P50539 228 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 GAD2Q05329 585 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 KBTBD6Q86V97 674 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC42-203ENST00000581598 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 PRCPP42785 496 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 SLC6A11P48066 632 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 PGFP49763 221 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 HTR3DQ70Z44 454 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 RASSF3Q86WH2 238 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 C12orf40Q86WS4 652 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 ZNF276Q8N554 614 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 SEMA4DQ92854 862 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 NACA2Q9H009 215 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 RAB20Q9NX57 234 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 SLC30A4O14863 429 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 KAT7O95251 611 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 SMC2O95347 1197 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 CD58P19256 250 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 GRIA2P42262 883 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 TNFRSF4P43489 277 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 KIF11P52732 1056 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 PLK5Q496M5 336 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 C2orf27AQ580R0 203 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC42-203ENST00000581598 TSG101Q99816 390 aa22.06■■□□□ 1.12
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