RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 CXCL11O14625 94 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 FFAR2O15552 330 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 THAP12O43422 761 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SLC43A1O75387 559 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 C8AP07357 584 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RARBP10826 455 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 IL1R1P14778 569 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 CFPP27918 469 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 EPHB4P54760 987 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RAP2BP61225 183 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 VGLL4Q14135 290 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 RALBP1Q15311 655 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PROSER3Q2NL68 480 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 FAM83AQ86UY5 434 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 LGI4Q8N135 537 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MPP5Q8N3R9 675 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 SNX22Q96L94 193 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 TCF25Q9BQ70 676 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 DPH1Q9BZG8 443 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 JKAMPQ9P055 326 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-208ENST00000578600 NUP98P52948 1817 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PRX2 142 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 B5MCH6 92 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 BTBD19C9JJ37 291 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 MYO1CO00159 1063 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 PDHXO00330 501 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM13O60858 407 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 STC2O76061 302 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 ABHD16AO95870 558 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 AMHP03971 560 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 CR2P20023 1033 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 FGFR2P21802 821 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 CCT5P48643 541 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 CLRN1P58418 232 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRM-208ENST00000578600 MPEG1Q2M385 716 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF365Q70YC5 407 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 RNF44Q7L0R7 432 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 SYT8Q8NBV8 401 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 MUL1Q969V5 352 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRM-208ENST00000578600 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 NDC1Q9BTX1 674 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 NELFAQ9H3P2 528 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 CEP290O15078 2479 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRM-208ENST00000578600 CLRN2A0PK11 232 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF785A8K8V0 405 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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PTPRM-208ENST00000578600 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 HAUS5O94927 633 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 POMCP01189 267 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRM-208ENST00000578600 CTBP1Q13363 440 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRM-208ENST00000578600 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 PDSS2Q86YH6 399 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 FANCBQ8NB91 859 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 MAML1Q92585 1016 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 TOX2Q96NM4 488 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB118Q96PH6 123 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-208ENST00000578600 LMF1Q96S06 567 aa6.26□□□□□ -1.41
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