RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AGAP11Q8TF27 550 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNPEPQ9ULA0 475 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRPV2Q9Y5S1 764 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT7P08729 469 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FGFR1P11362 822 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRAMD1AQ96CP6 724 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZFP42Q96MM3 310 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HESX1Q9UBX0 185 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF8O76064 485 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ASMTLO95671 621 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCNB1P14635 433 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAF6P49848 677 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UNC93AQ86WB7 457 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DENND1AQ8TEH3 1009 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAYSD1Q9NPB0 183 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLHL14Q9P2G3 628 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 L3MBTL1Q9Y468 752 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SEPT4O43236 478 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LMO2P25791 158 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MIPP30301 263 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LMNB2Q03252 620 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC15Q0P6D6 951 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PKDCCQ504Y2 493 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP128Q6ZU80 1094 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TDRPQ86YL5 185 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CFAP57Q96MR6 1250 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MIS12Q9H081 205 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM33Q9UPN9 1127 aa25.14■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPD1P21695 349 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTPN7P35236 360 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PNPLA4P41247 253 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DYNLT1P63172 113 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL9RQ01113 521 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CAP1Q01518 475 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRNP1Q6NT89 227 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RSPH3Q86UC2 560 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A8MUI8 341 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC130P13994 396 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDGFRAP16234 1089 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADORA2BP29275 332 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDE4CQ08493 712 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAF5Q15542 800 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALLCQ8N6M5 410 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APPL2Q8NEU8 664 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RXFP2Q8WXD0 754 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSPH1Q92598 858 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PITPNM3Q9BZ71 974 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNX25Q9H3E2 840 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ASNSD1Q9NWL6 643 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTGESO14684 152 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ETS1P14921 441 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NR1H3Q13133 447 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDO1Q16878 200 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SV2CQ496J9 727 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GDAP2Q9NXN4 497 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP18Q9UMW8 372 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF148Q9UQR1 794 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C2CD4BA6NLJ0 364 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD48P09326 243 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAB6CQ53S08 254 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM47EQ6ZV65 393 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCUBE3Q8IX30 993 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC35F5Q8WV83 523 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAB6CQ9H0N0 254 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPAG7O75391 227 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHRNA1P02708 482 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ELNP15502 786 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KDELR1P24390 212 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC18A1P54219 525 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC25Q96NG3 672 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNPY3Q9BT09 278 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CACNG4Q9UBN1 327 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms