RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf159Q96HA4 380 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TTC25Q96NG3 672 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RUNDC3BQ96NL0 473 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 FNBP1Q96RU3 617 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MPHOSPH9Q99550 1183 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TCF25Q9BQ70 676 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SLF1Q9BQI6 1058 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TXLNGYQ9BZA5 131 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM4Q9C037 500 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 NT5C3AQ9H0P0 336 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf112Q9NSG2 853 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MOCS1Q9NZB8 636 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TEKT2Q9UIF3 430 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 KDM2BQ8NHM5 1336 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP10A1A4S6 786 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM221A6NGB7 291 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM75PA6NK02 468 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8BA8MQT2 603 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 B4E171 279 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 E9PMD0 336 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8SH3BPF8 625 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PSMD9O00233 223 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 VWA5AO00534 786 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZW10O43264 779 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SRGAP2O75044 1071 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SLC22A3O75751 556 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM16O95361 564 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 EYA4O95677 639 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 STARD3NLO95772 234 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 LMNAP02545 664 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 LTFP02788 710 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HMGCRP04035 888 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HEXBP07686 556 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HPGDP15428 266 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CSF2RAP15509 400 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 JAK1P23458 1154 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PRKAR2BP31323 418 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RPL9P32969 192 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 IDUAP35475 653 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CETN2P41208 172 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ALDH3A2P51648 485 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PMS2P54278 862 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SLC26A5P58743 744 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 OLR1P78380 273 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 FSTL1Q12841 308 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CRHR2Q13324 411 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MAPRE2Q15555 327 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DDR2Q16832 855 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 WDR72Q3MJ13 1102 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CFAP100Q494V2 611 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 FUT11Q495W5 492 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO43Q4G163 708 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 KCNT1Q5JUK3 1230 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 WDR73Q6P4I2 378 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 OLFM4Q6UX06 510 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 NLRP9Q7RTR0 991 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 OSTM1Q86WC4 334 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 KRT73Q86Y46 540 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 P3H2Q8IVL5 708 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 C10orf67Q8IYJ2 551 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD35Q8N283 1001 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PPM1NQ8N819 430 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 AVL9Q8NBF6 648 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 XXYLT1Q8NBI6 393 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SLC4A11Q8NBS3 891 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB44Q8NCP5 570 aa3.25□□□□□ -1.89
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