RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 GAB4Q2WGN9 574 aa32.02■■■□□ 2.72
CTDNEP1-206ENST00000571409 CCDC40Q4G0X9 1142 aa32.02■■■□□ 2.72
CTDNEP1-206ENST00000571409 TTI2Q6NXR4 508 aa32.02■■■□□ 2.72
CTDNEP1-206ENST00000571409 NELFBQ8WX92 580 aa32.02■■■□□ 2.72
CTDNEP1-206ENST00000571409 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa32.02■■■□□ 2.72
CTDNEP1-206ENST00000571409 HOXA6P31267 233 aa32.01■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 CUL2Q13617 745 aa32.01■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 KIAA2013Q8IYS2 634 aa32.01■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC8A2Q9UPR5 921 aa32.01■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 CTNND2Q9UQB3 1225 aa32.01■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 ATG2BQ96BY7 2078 aa32■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa32■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 OSER1Q9NX31 292 aa32■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 RAB23Q9ULC3 237 aa32■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa32■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 BICDL2A1A5D9 508 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 TBX18O95935 607 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 IRF1P10914 325 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 FMO5P49326 533 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 KIF11P52732 1056 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 LPAL2Q16609 132 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 RHBDF2Q6PJF5 856 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 PRR23BQ6ZRT6 265 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 OTUB2Q96DC9 234 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 NMUR1Q9HB89 426 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 CYLDQ9NQC7 956 aa31.99■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 A0A1W2PQH9 124 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 HRO43593 1189 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 ADH1CP00326 375 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 LRMPQ12912 555 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 ARHGAP17Q68EM7 881 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 WDR5BQ86VZ2 330 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 WBP2Q969T9 261 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 CHMP5Q9NZZ3 219 aa31.98■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 ADH5P11766 374 aa31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 CNR2P34972 360 aa31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 FOXR2Q6PJQ5 311 aa31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa31.97■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 RARGP13631 454 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 PXNP49023 591 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 STX17P56962 302 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 UBE2HP62256 183 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 LY6G5CQ5SRR4 150 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 CCDC186Q7Z3E2 898 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 BBS7Q8IWZ6 715 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 GMEB2Q9UKD1 530 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 USP3Q9Y6I4 520 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 FRYLO94915 3013 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC6A11P48066 632 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 PAK1Q13153 545 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 C12orf40Q86WS4 652 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 CCDC26Q8TAB7 109 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 ACDQ96AP0 544 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 NAGPAQ9UK23 515 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 NUDT5Q9UKK9 219 aa31.95■■■□□ 2.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF292O60281 2723 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 K7EQS6 105 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 PMM2O15305 246 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 PSEN1P49768 467 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 SEC13P55735 322 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 LAIR1Q6GTX8 287 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 SYT13Q7L8C5 426 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 SCD5Q86SK9 330 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 TTC30AQ86WT1 665 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 CAMKK1Q8N5S9 505 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 ANKRD52Q8NB46 1076 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 HHIPQ96QV1 700 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 PNKPQ96T60 521 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 MYOFQ9NZM1 2061 aa31.94■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC8A3P57103 927 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 GAD2Q05329 585 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 GOLGA8FQ08AF8 430 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 CAMK4Q16566 473 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 SGO2Q562F6 1265 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 PIGZQ86VD9 579 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 UBR7Q8N806 425 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 NT5C1BQ96P26 610 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 UBXN6Q9BZV1 441 aa31.93■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 MDM4O15151 490 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 CD19P15391 556 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 MESP2Q0VG99 397 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 DMC1Q14565 340 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 C2orf27AQ580R0 203 aa31.92■■■□□ 2.7
CTDNEP1-206ENST00000571409 C10orf120Q5SQS8 335 aa31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms