RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 GCNT1Q02742 428 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNH2Q12809 1159 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 SGO2Q562F6 1265 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHDC10Q6PID8 442 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 TADA2BQ86TJ2 420 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF276Q8N554 614 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBR7Q8N806 425 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHFRQ96EP1 664 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 P2RY13Q9BPV8 354 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP3Q9Y6I4 520 aa18.03■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 VDRP11473 427 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCAT1P54687 386 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLGA8FQ08AF8 430 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRMPQ12912 555 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERMP1Q7Z2K6 904 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP18Q8N392 663 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPM1KQ8N3J5 372 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB44Q8NCP5 570 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMO3Q8TAP4 145 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATRIPQ8WXE1 791 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD101Q93033 1021 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 GBP4Q96PP9 640 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUP62CLQ9H1M0 184 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00597Q9H2U6 94 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 HESX1Q9UBX0 185 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 DACH1Q9UI36 760 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 R4GN57 208 aa18.02■□□□□ 0.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa18.02■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 DMXL1Q9Y485 3027 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO16Q9Y6X6 1858 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP26A1O43174 497 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATG13O75143 517 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADH1CP00326 375 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMNAP02545 664 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 TDGF1P13385 188 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 GAS6Q14393 721 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 STILQ15468 1287 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 FSTL4Q6MZW2 842 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 EHBP1Q8NDI1 1231 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM81BQ96LP2 452 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.01■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP17A1P05093 508 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 SETSIPP0DME0 302 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 RALAP11233 206 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD19P15391 556 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 HOXA6P31267 233 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 ID4P47928 161 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 GALK1P51570 392 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 BST2Q10589 180 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB41Q5JT25 222 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMYD5Q6GMV2 418 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM270Q6UE05 265 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q6ZS52 159 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIGZQ86VD9 579 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAGPAQ9UK23 515 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPAN16Q9UKR8 245 aa18■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1W2PQH9 124 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 O00370 1275 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 LILRB5O75023 590 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 SATB1Q01826 763 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHCR24Q15392 516 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC30AQ86WT1 665 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM114A1Q8IWE2 563 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 OSER1Q9NX31 292 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNMT3LQ9UJW3 386 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa17.99■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.98■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 EGFP01133 1207 aa17.98■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 RARGP13631 454 aa17.98■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLA2G4AP47712 749 aa17.98■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 PGFP49763 221 aa17.98■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 C10orf120Q5SQS8 335 aa17.98■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 PM20D1Q6GTS8 502 aa17.98■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSSK4Q6SA08 328 aa17.98■□□□□ 0.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCLAT1Q6UWP7 414 aa17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms