RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	POTEA	Q6S8J7	498 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	TLE6	Q9H808	572 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	DPP3	Q9NY33	737 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WZ62	844 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF487	B1APH4	448 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	KCNN4	O15554	427 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	DIAPH2	O60879	1101 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	PIAS1	O75925	651 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	ZBED1	O96006	694 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	SETSIP	P0DME0	302 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	INSRR	P14616	1297 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	FAAP100	Q0VG06	881 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	MTM1	Q13496	603 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	LONP2	Q86WA8	852 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC6	Q86X45	466 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO41	Q8TF61	875 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	COPS5	Q92905	334 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	ACAP3	Q96P50	834 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	MROH8	Q9H579	483 aa		19.16	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	ASB14	A6NK59	587 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	KLF11	O14901	512 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	TOMM70	O94826	608 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	CBX6	O95503	412 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	NEFH	P12036	1026 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	SDC4	P31431	198 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	IGBP1	P78318	339 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	CDO1	Q16878	200 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC14	Q49A88	953 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	ERO1B	Q86YB8	467 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	SERAC1	Q96JX3	654 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	AKT3	Q9Y243	479 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	MDM4	O15151	490 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC22	O60826	627 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC6	O75061	913 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	PYGB	P11216	843 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	ARFIP2	P53365	341 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	LAMC2	Q13753	1193 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	CRYM	Q14894	314 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	TRNP1	Q6NT89	227 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	FAM13C	Q8NE31	585 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	OTUD5	Q96G74	571 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF670	Q9BS34	389 aa		19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	19.15	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		19.14	■□□□□ 0.66
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JND7	137 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	COPE	O14579	308 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CYP3A5	P20815	502 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	OSBP	P22059	807 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CALB2	P22676	271 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	IL4R	P24394	825 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	NRL	P54845	237 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	MCU	Q8NE86	351 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		19.14	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	HAUS5	O94927	633 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PRKCH	P24723	683 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SLC6A3	Q01959	620 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	SESTD1	Q86VW0	696 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRN2	Q92932	1015 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP36	Q96G28	342 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	CPB2	Q96IY4	423 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ELP3	Q9H9T3	547 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		19.13	■□□□□ 0.65
RRN3-205	ENST00000563559	HEY2	Q9UBP5	337 aa		19.13	■□□□□ 0.65

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