RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 HSD17B7P56937 341 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TAP1Q03518 808 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ATP1A4Q13733 1029 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SLC39A14Q15043 492 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 STK11Q15831 433 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CNGA2Q16280 664 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TTMPQ5BVD1 217 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SPRYD7Q5W111 196 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ATL1Q8WXF7 558 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FAM161BQ96MY7 647 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EHD1Q9H4M9 534 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MALT1Q9UDY8 824 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FAM196BA6NMK8 535 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 B8ZZF3 427 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SPTLC1O15269 473 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 STX2P32856 288 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ACADSBP45954 432 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TBX4P57082 545 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ERICH1Q86X53 443 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GINS4Q9BRT9 223 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MPP6Q9NZW5 540 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 AP4S1Q9Y587 144 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 AOC2O75106 756 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PFKMP08237 780 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SLC2A3P11169 496 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 GPD1LQ8N335 351 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 LXNQ9BS40 222 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MAPK13O15264 365 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 UPP2O95045 317 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 BEND5Q7L4P6 421 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 ENKURQ8TC29 256 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RPTORQ8N122 1335 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PQ72 361 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PIK3CDO00329 1044 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MFN2O95140 757 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CCL5P13501 91 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ADORA2AP29274 412 aa6.52□□□□□ -1.37
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