RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 M0QYV0 167 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 CAPN9O14815 690 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 COCHO43405 550 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 ZNF18P17022 549 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 GJA4P35212 333 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 PTGER3P43115 390 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 FAM35AQ86V20 835 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 PIGZQ86VD9 579 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TIGD1Q96MW7 591 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 UROC1Q96N76 676 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 SMOQ99835 787 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 KCND2Q9NZV8 630 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 ANO9A1A5B4 782 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 M0QZQ0 153 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 LEFTY2O00292 366 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 GARTP22102 1010 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 LRPAP1P30533 357 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TKTL1P51854 596 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TSG101Q99816 390 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TASP1Q9H6P5 420 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 RAB20Q9NX57 234 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 RAB23Q9ULC3 237 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 OR6C75A6NL08 312 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 PSMA7O14818 248 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TADA3O75528 432 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 IL18RAPO95256 599 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TPM3P06753 285 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.146e-13■■□□□ 11.4
CS-212ENST00000548567 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 LRRC73Q5JTD7 316 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 ITIH5Q86UX2 942 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 CGRRF1Q99675 332 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 STK24Q9Y6E0 443 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 CKAP5Q14008 2032 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 HRO43593 1189 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 SMC2O95347 1197 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 FAM200BP0CF97 657 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 CSH1P0DML2 217 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 CSH2P0DML3 217 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 GTF2H1P32780 548 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 ATP11AP98196 1134 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TMC8Q8IU68 726 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TFAP2BQ92481 460 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 PPME1Q9Y570 386 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 GIPC1O14908 333 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 THAP12O43422 761 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 SRGAP2O75044 1071 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 NCAM1P13591 858 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 FCARP24071 287 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 GJC1P36383 396 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 LHX1P48742 406 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 IL9RQ01113 521 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 KCNH2Q12809 1159 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.94□□□□□ -1.14
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