RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 GOLGA8RI6L899 631 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TK2O00142 265 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TM9SF1O15321 606 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CAND2O75155 1236 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RBP1P09455 135 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CCNG1P51959 295 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF544Q6NX49 715 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 USP33Q8TEY7 942 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 BSNDQ8WZ55 320 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CASP10Q92851 521 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 POLD4Q9HCU8 107 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ITGALP20701 1170 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CYP2A7P20853 494 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 S100A5P33763 92 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MAP3K7CLP57077 242 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NAA20P61599 178 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DDI1Q8WTU0 396 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 REPS1Q96D71 796 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 WDR41Q9HAD4 459 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KLK14Q9P0G3 267 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MYO1CO00159 1063 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D12O60347 775 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GLP2RO95838 553 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ADORA2AP29274 412 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GIT2Q14161 759 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 IKBKEQ14164 716 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM199Q8N511 208 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 USP38Q8NB14 1042 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 VPS50Q96JG6 964 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINB11Q96P15 392 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PEAK1Q9H792 1746 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PLSCR1O15162 318 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RRM2P31350 389 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PSEN1P49768 467 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ADCY6O43306 1168 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SLC37A4O43826 429 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PSEN2P49810 448 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SGCGQ13326 291 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ACVR2BQ13705 512 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CES5AQ6NT32 575 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ACOT1Q86TX2 421 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TERB1Q8NA31 727 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 REPS2Q8NFH8 660 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KRT84Q9NSB2 600 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PMPCBO75439 489 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PAEPP09466 180 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MSH3P20585 1137 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PRIM2P49643 509 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TLK2Q86UE8 772 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC6Q86X45 466 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 JAMLQ86YT9 394 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 APOL5Q9BWW9 433 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CISHQ9NSE2 258 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FKBP9O95302 570 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GYPCP04921 128 aa6.6□□□□□ -1.35
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