RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 C2orf27AQ580R0 203 aa9.52□□□□□ -0.89
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LMO3-222ENST00000540445 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 KLHL10Q6JEL2 608 aa9.52□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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LMO3-222ENST00000540445 ARID3AQ99856 593 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 NAGPAQ9UK23 515 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 NUDT5Q9UKK9 219 aa9.5□□□□□ -0.89
LMO3-222ENST00000540445 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.5□□□□□ -0.89
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